RNA–Protein interactions for RNA: YFR049W

YMR31, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene YMR31, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR31	YFR049W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	CIN4	P39110	191 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	NET1	P47035	1189 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YGR149W	P48236	432 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	GND2	P53319	492 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YTP1	P53584	459 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	DUG3	P53871	357 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	TOF2	Q02208	771 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	HOT1	Q03213	719 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	COQ9	Q05779	260 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	MMR1	Q06324	491 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	ULA1	Q12059	462 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	DAL5	P15365	543 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	URA4	P20051	364 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	ELO2	P25358	347 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	RAD14	P28519	371 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YIM1	P28625	365 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	LTV1	P34078	463 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	HEL1	P36113	551 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	ARA1	P38115	344 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	SLM4	P38247	162 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	WSS1	P38838	269 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	PES4	P39684	611 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	ERV46	P39727	415 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	ATF1	P40353	525 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	SDS3	P40505	327 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	GPI8	P49018	411 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	FMS1	P50264	508 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YGR126W	P53274	230 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	FMP30	Q02883	468 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	TMN2	Q04562	672 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	PDR8	Q06149	701 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YLR455W	Q06188	304 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	RTT109	Q07794	436 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.66	□□□□□ -1.98	not detected
YMR31	YFR049W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	AEP3	Q12089	606 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	YLR278C	Q05854	1341 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YMR31	YFR049W	COR1	P07256	457 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	SPS4	P09937	338 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.65	□□□□□ -1.99	not detected
YMR31	YFR049W	MSP1	P28737	362 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	DAD2	P36162	133 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	STV1	P37296	890 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	ROT2	P38138	954 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	MMS4	P38257	691 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	MBB1	P39534	108 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	YJL107C	P42947	387 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	MDE1	P47095	244 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	URB2	P47108	1174 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	COS5	P47187	383 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	ORC5	P50874	479 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	TOF1	P53840	1238 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	SKO1	Q02100	647 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	ADA2	Q02336	434 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	MSC1	Q03104	513 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	ACL4	Q03771	387 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	PPM1	Q04081	328 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	YMR130W	Q04223	302 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	COS7	Q07788	383 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	MCH4	Q08268	501 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	YDR061W	Q12298	539 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	SKS1	Q12505	502 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	RAV1	P47104	1357 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	RPN13	O13563	156 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	PDE2	P06776	526 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	GPA1	P08539	472 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	SNF3	P10870	884 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	SPO7	P18410	259 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	SPO11	P23179	398 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	OCT1	P35999	772 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	PXL1	P36166	706 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	SIF2	P38262	535 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
YMR31	YFR049W	SER3	P40054	469 aa		2.64	□□□□□ -1.99

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