RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C GSH2Q08220 491 aa2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C PLP2Q12017 286 aa2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C SGT2Q12118 346 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C ATG9Q12142 997 aa2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C RRP6Q12149 733 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data2.34□□□□□ -2.03not detected
GCN4YEL009C RRI1Q12468 440 aa2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C SEC12P11655 471 aa2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C SPO12P17123 173 aa2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C CDC42P19073 191 aa2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C COX11P19516 300 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C RSA4P25382 515 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C ADK2P26364 225 aa2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C SPC110P32380 944 aa2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C PLC1P32383 869 aa2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C CBF2P32504 956 aa2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C CSE2P33308 149 aa2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C RRP14P36080 434 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C HEL1P36113 551 aa2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C JNM1P36224 373 aa2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C STB5P38699 743 aa2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C ERV46P39727 415 aa2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C BUD16P39988 312 aa2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C KAP123P40069 1113 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C GPP1P41277 250 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C AZF1P41696 914 aa2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C SMC3P47037 1230 aa2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C RNH70P53331 553 aa2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C ESBP6P53918 673 aa2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C UME1Q03010 460 aa2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C PPM1Q04081 328 aa2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C YLR455WQ06188 304 aa2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C CDD1Q06549 142 aa2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C ABP140Q08641 628 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C YOR389WQ08912 624 aa2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C APL4Q12028 832 aa2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C LCB4Q12246 624 aa2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C GIS3Q12418 502 aa2.33□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C HAP2P06774 265 aa2.32□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C REV1P12689 985 aa2.32□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C CDC23P16522 626 aa2.32□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C VPS3P23643 1011 aa2.32□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C DAL2P25335 343 aa2.32□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C RRT12P25381 491 aa2.32□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C MFT1P33441 392 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C CSG2P35206 410 aa2.32□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C AGP2P38090 596 aa2.32□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C SMC2P38989 1170 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C SAP1P39955 897 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C PCL6P40038 420 aa2.32□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C COS12P53053 380 aa2.32□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C DRN1P53255 507 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data2.32□□□□□ -2.04not detected
GCN4YEL009C PNG1Q02890 363 aa2.32□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C EMI2Q04409 500 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C YML053CQ04978 212 aa2.32□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C VPS38Q05919 439 aa2.32□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C OPY2Q06810 360 aa2.32□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C TSR1Q07381 788 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C GPN2Q08726 347 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C YPR027CQ12079 277 aa2.32□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C AHC1Q12433 566 aa2.32□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C CTF3Q12748 733 aa2.32□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa2.32□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C MOT1P32333 1867 aa2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C RIF1P29539 1916 aa2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C GAL80P04387 435 aa2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C RPS3P05750 240 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C SNF1P06782 633 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C CDC33P07260 213 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C CHS1P08004 1131 aa2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C MTF2P10849 440 aa2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C KGD2P19262 463 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C AEP2P22136 580 aa2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C ARG1P22768 420 aa2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C EFB1P32471 206 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C VPH1P32563 840 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C YKL050CP35736 922 aa2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C KDX1P36005 433 aa2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C HMT1P38074 348 aa2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C PCH2P38126 564 aa2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C FMP10P40098 244 aa2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C YTA12P40341 825 aa2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C PHO86P46956 311 aa2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C POL31P46957 487 aa2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C YJR054WP47114 497 aa2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C RNR4P49723 345 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C DIG1Q03063 452 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C PLM2Q04383 521 aa2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C SDH5Q08230 162 aa2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C YOR378WQ08902 515 aa2.31□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C JIP3O13555 125 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C TPK1P06244 397 aa2.3□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C ATP1P07251 545 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
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