RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ACAD11Q709F0 780 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KIF18BQ86Y91 864 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPIL6Q8IXY8 311 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SMC1BQ8NDV3 1235 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ORAI3Q9BRQ5 295 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VTA1Q9NP79 307 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OBP2AQ9NY56 170 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COQ6Q9Y2Z9 468 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MEGF11A6BM72 1044 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRRN2O75325 713 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PF4V1P10720 104 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NAT1P18440 290 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ITIH2P19823 946 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PAX3P23760 479 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VPS72Q15906 364 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRAPPC3LQ5T215 181 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KREMEN2Q8NCW0 462 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SVIPQ8NHG7 77 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHTF18Q8WVB6 975 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNF141Q8WVD5 230 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ACDQ96AP0 544 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TIFAQ96CG3 184 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FBXL18Q96ME1 805 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MENTQ9BUN1 341 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ASPNQ9BXN1 380 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF700Q9H0M5 742 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNF208Q9H0X6 261 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EMC7Q9NPA0 242 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MINPP1Q9UNW1 487 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 H0Y8X5 98 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 STXBP3O00186 592 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LSSP48449 732 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ILDR2Q71H61 639 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C11orf74Q86VG3 221 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IFNL3Q8IZI9 196 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DCAF11Q8TEB1 546 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BTBD6Q96KE9 485 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LGR6Q9HBX8 967 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CABP5Q9NP86 173 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPTLC3Q9NUV7 552 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRAF5O00463 557 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ULK1O75385 1050 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLITRK5O94991 958 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 THBDP07204 575 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RAB6AP20340 208 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AMPD1P23109 780 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GRIK1P39086 918 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ETV3P41162 512 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPR85P60893 370 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ERVK-21P61565 698 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LONRF3Q496Y0 759 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IL31Q6EBC2 164 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FDX2Q6P4F2 183 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMC3Q7Z5M5 1100 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C11orf96Q7Z7L8 435 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DTWD1Q8N5C7 304 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 USP33Q8TEY7 942 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CLIP3Q96DZ5 547 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRGUKQ96M69 825 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRDM11Q9NQV5 511 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARVCFO00192 962 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SH3BP5O60239 455 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPFIA4O75335 1185 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TIAF1O95411 115 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CKMP06732 381 aa6.32□□□□□ -1.4
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