RNA–Protein interactions for RNA: YER167W

BCK2, Transcript of Serine/threonine-rich protein involved in PKC1 signaling pathway, yeast

Gene BCK2, Length 2,556 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BCK2	YER167W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	MET28	P40573	187 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	YJR124C	P47159	448 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	PEF1	P53238	335 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	GCN5	Q03330	439 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	RSM24	Q03976	319 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	GPN3	Q06543	272 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	VAM6	Q07468	1049 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	BSC6	Q08280	497 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	MUM3	Q08750	479 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	DAS2	Q12084	232 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	MSF1	P08425	469 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	VPS34	P22543	875 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	NDI1	P32340	513 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	YAP3	P38749	330 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	RCY1	P39531	840 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	VAB2	P40003	282 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	ATP25	Q03153	612 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	PRM15	Q03262	622 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	SMA2	Q04658	369 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	YDR222W	Q04925	415 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	ATG23	Q06671	453 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	RTT109	Q07794	436 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	BMT6	Q12291	365 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	YDR262W	Q12331	272 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	ATG31	Q12421	196 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	CBP1	P07252	654 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	CTR86	P25355	563 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	PER1	P25625	357 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	MRP20	P32387	263 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	ALY1	P36117	915 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	CST26	P38226	397 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	SFB3	P38810	929 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.97	□□□□□ -1.77	not detected
BCK2	YER167W	RGI2	P40188	164 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	QDR2	P40474	542 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	RTS2	P40962	232 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	IRC5	P43610	853 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	YGL159W	P53110	370 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	ORM1	P53224	222 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	OKP1	P53298	406 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	MRPL50	P53724	139 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	ORC4	P54791	529 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	DML1	Q03652	475 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	PPN1	Q04119	674 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	PEX12	Q04370	399 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	STE23	Q06010	1027 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	SYO1	Q07395	620 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	YOL019W	Q08157	551 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	TRE1	Q08919	783 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	SVS1	Q12254	260 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	YDR061W	Q12298	539 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	PTC5	Q12511	572 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	SET6	Q12529	373 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	MSN1	P22148	382 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	SNT1	P25357	1226 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	PET18	P25362	215 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	PBN1	P25580	416 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	AGP2	P38090	596 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	FIG1	P38224	298 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	FES1	P38260	290 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	YBR242W	P38331	238 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.97	□□□□□ -1.77	not detected
BCK2	YER167W	IRC7	P43623	340 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	TOS3	P43637	560 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	NMD5	P46970	1048 aa		3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
BCK2	YER167W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77

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