RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C ALG12P53730 551 aa2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C TIM8P57744 87 aa2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C BET4Q00618 327 aa2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C YML119WQ03208 357 aa2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C EBS1Q03466 884 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C ARA2Q04212 335 aa2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C HCR1Q05775 265 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C ECM7Q06200 448 aa2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C RSA1Q08932 381 aa2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C LYS21Q12122 440 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C APM4Q99186 491 aa2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C ECM29P38737 1868 aa2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C COX4P04037 155 aa2.36□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C SSB1P11484 613 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C CNA1P23287 553 aa2.36□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C MUD1P32605 298 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C PPG1P32838 368 aa2.36□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C SKG6P32900 734 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C MIC60P36112 540 aa2.36□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C MRPL10P36520 322 aa2.36□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C MRX3P38172 270 aa2.36□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C CTM1P38818 585 aa2.36□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C SPT8P38915 602 aa2.36□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C SSB2P40150 613 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C LAS21P40367 830 aa2.36□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C LAM5P43560 674 aa2.36□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data2.36□□□□□ -2.03not detected
GCN4YEL009C HSH155P49955 971 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C ORC5P50874 479 aa2.36□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C SHE10P53075 577 aa2.36□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C TRS130Q03660 1102 aa2.36□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C UTP14Q04500 899 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C DON1Q05610 365 aa2.36□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C COG4Q06096 861 aa2.36□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C RAD34Q06665 692 aa2.36□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C SHS1Q07657 551 aa2.36□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C RLP24Q07915 199 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C NGL1Q08213 363 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C PCD1Q12524 340 aa2.36□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C Q0010Q9ZZX9 128 aa2.36□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C YPR117WQ06116 2489 aa2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C ADE4P04046 510 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C ASP3-2P0CX77 362 aa2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C ASP3-3P0CX78 362 aa2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C ASP3-4P0CX79 362 aa2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C ASP3-1P0CZ17 362 aa2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C RPL4AP10664 362 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C GLN3P18494 730 aa2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C PHO13P19881 312 aa2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C RRP43P25359 394 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C PRR1P28708 518 aa2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C BUD2P33314 1104 aa2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C MPE1P35728 441 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C YKL023WP36103 277 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C MMS4P38257 691 aa2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C EFM2P38347 419 aa2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C YND1P40009 630 aa2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C FYV8P46949 817 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C MNN11P46985 422 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C COS5P47187 383 aa2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C RPL4BP49626 362 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C PEF1P53238 335 aa2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C VPS75P53853 264 aa2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C YNL134CP53912 376 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C ALG11P53954 548 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C CWC21Q03375 135 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C YLR297WQ05899 129 aa2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C PFA4Q12006 378 aa2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C SLX4Q12098 748 aa2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C YER175W-AQ8TGU4 54 aa2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C TOR1P35169 2470 aa2.35□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C HIP1P06775 603 aa2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C NAT1P12945 854 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C AMD2P22580 549 aa2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C DAL3P32459 195 aa2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C SWI3P32591 825 aa2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C XRS2P33301 854 aa2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C NIP100P33420 868 aa2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C EBP2P36049 427 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C SDH8P38345 138 aa2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C YHL026CP38740 315 aa2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C YHR054CP38780 354 aa2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C VFA1P40080 203 aa2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C YER186CP40101 306 aa2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C ESL1P40456 1118 aa2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C YJL107CP42947 387 aa2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C CPR7P47103 393 aa2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C ALT2P52892 507 aa2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C GPG1P53130 126 aa2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C COG2P53271 262 aa2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C IMP4P53941 290 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C SKY1Q03656 742 aa2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C YLR287CQ05881 355 aa2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C CSR1Q06705 408 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C YPR078CQ06813 372 aa2.34□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
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