RNA–Protein interactions for RNA: YOL006C

TOP1, Transcript of Topoisomerase I, yeast

Gene TOP1, Length 2,310 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOP1	YOL006C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	AFG3	P39925	761 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	SER3	P40054	469 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	GID8	P40208	455 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	MSS2	P40990	351 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	FMS1	P50264	508 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	PIB2	P53191	635 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	PGA2	P53903	129 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	SDH1	Q00711	640 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	URC2	Q04411	772 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	XYL2	Q07993	356 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	SGO1	Q08490	590 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	YPL272C	Q08984	517 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	MED4	Q12343	284 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	GIS3	Q12418	502 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	YLL067C	Q07888	1374 aa		3.4	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	SOD2	P00447	233 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	STE3	P06783	470 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	CBP1	P07252	654 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	GPA1	P08539	472 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	ERS1	P17261	260 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	NDI1	P32340	513 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	RML2	P32611	393 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	STV1	P37296	890 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	STB5	P38699	743 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	SFB3	P38810	929 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	ELO3	P40319	345 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	ALG5	P40350	334 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	IME4	P41833	600 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	CTK2	P46962	323 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	ECM27	P47144	725 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YGR149W	P48236	432 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YDL183C	P48569	320 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	NCE103	P53615	221 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	UBP2	Q01476	1272 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	VPS36	Q06696	566 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YFH1	Q07540	174 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	MET32	Q12041	191 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	ELG1	Q12050	791 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	LAM4	P38800	1345 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	COQ4	O13525	335 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	JIP3	O13555	125 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	RSR1	P13856	272 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	PET18	P25362	215 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	ACP1	P32463	125 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YKL070W	P36087	169 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YMR102C	Q03177	834 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	ASM4	Q05166	528 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	RTC1	Q08281	1341 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YME1	P32795	747 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YKR015C	P36111	568 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	AGP2	P38090	596 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YRB2	P40517	327 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	MND2	P40577	368 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YJL132W	P47014	750 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	BOP3	P53958	396 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	KTR6	P54070	446 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	ACL4	Q03771	387 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	CRF1	Q04930	467 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	YOR223W	Q12015	292 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	SVS1	Q12254	260 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	SPO7	P18410	259 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	DAL81	P21657	970 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	CDC15	P27636	974 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	ITR1	P30605	584 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TOP1	YOL006C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87

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