RNA–Protein interactions for RNA: YMR009W

ADI1, Transcript of Acireductone dioxygenease involved in the methionine salvage pathway, yeast

Gene ADI1, Length 540 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ADI1	YMR009W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	IRC8	P47046	822 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	MRK1	P50873	501 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	THI3	Q07471	609 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	RIM20	Q12033	661 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	YLR049C	Q12110	428 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	GRX6	Q12438	231 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	YPT6	Q99260	215 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.09	□□□□□ -1.91	not detected
ADI1	YMR009W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	GSH1	P32477	678 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	SEF1	P34228	1148 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	APD1	P38281	316 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	UIP3	P39547	235 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	MET18	P40469	1032 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	PKP1	P40530	394 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	MAF1	P41910	395 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	YFR020W	P43600	232 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	CTK2	P46962	323 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	NNF2	P53253	936 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	YGR127W	P53275	312 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	JJJ1	P53863	590 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	ERO1	Q03103	563 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	BUD7	Q08754	746 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	YPL272C	Q08984	517 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	INP53	Q12271	1107 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	SPE4	Q12455	300 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ADI1	YMR009W	REV3	P14284	1504 aa		3.09	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	AQY1	P0CD91	305 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	CLB3	P24870	427 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	ADK2	P26364	225 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	SMF1	P38925	575 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	YEL057C	P39983	233 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	ALG5	P40350	334 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	YJL068C	P40363	299 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	MEP2	P41948	499 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	PTR3	P43606	678 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	FAR3	P46671	204 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	SMC3	P47037	1230 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	VPS9	P54787	451 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	PFA5	Q03289	374 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	YDR239C	Q03780	787 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	VPS38	Q05919	439 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	RAD34	Q06665	692 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	APL4	Q12028	832 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	ECM5	Q03214	1411 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	CHD1	P32657	1468 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	SSK2	P53599	1579 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	GAL80	P04387	435 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	PET111	P08468	800 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	RAP1	P11938	827 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	PMS1	P14242	873 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	GSY2	P27472	705 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	GPI10	P30777	616 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	MNN2	P38069	597 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	CST26	P38226	397 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	VID24	P38263	362 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	FTH1	P38310	465 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	PAC2	P39937	518 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	JEM1	P40358	645 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	SAE2	P46946	345 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	NET1	P47035	1189 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	ISA2	Q12425	185 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	AVL9	Q12500	764 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	YPK9	Q12697	1472 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	REC107	P21651	314 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	YCR006C	P25350	157 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	PEP1	P32319	1579 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	ICS2	P38284	255 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	CCT6	P39079	546 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	ELO1	P39540	310 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	LTP1	P40347	161 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	SSU1	P41930	458 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	ORC5	P50874	479 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	YPR003C	P53394	754 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	IPI3	P53877	555 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ADI1	YMR009W	CIK1	Q01649	594 aa		3.06	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22 ms