RNA–Protein interactions for RNA: YHR149C

SKG6, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene SKG6, Length 2,205 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SKG6	YHR149C	YKL100C	P34248	587 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	SKG1	P36169	355 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	EDS1	P38073	919 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	ALG14	P38242	237 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	MSG5	P38590	489 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	SOH1	P38633	127 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	GIC1	P38785	314 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.27	□□□□□ -1.73	not detected
SKG6	YHR149C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	RTT101	P47050	842 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	COX16	P47081	118 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	YGR153W	P48238	217 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	CWC24	P53769	259 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	ZDS2	P54786	942 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.27	□□□□□ -1.73	not detected
SKG6	YHR149C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	YML131W	Q03102	365 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	YLR297W	Q05899	129 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	FRE5	Q08908	694 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	THI21	Q08975	551 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	AEP3	Q12089	606 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	PSY3	Q12318	242 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	SPE4	Q12455	300 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	CTR86	P25355	563 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	CIN8	P27895	1000 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	KAP122	P32767	1081 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	SFA1	P32771	386 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	RER2	P35196	286 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	STB5	P38699	743 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	PLB1	P39105	664 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	YMR134W	P40207	237 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	YRB2	P40517	327 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	IRC8	P47046	822 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	VTC4	P47075	721 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	EFM3	P47163	339 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	RSN1	Q03516	953 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	CRF1	Q04930	467 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	UBX5	Q06682	500 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	THI20	Q08224	551 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	ATP14	Q12349	124 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	YPR1	Q12458	312 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	ARG3	P05150	338 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	STE3	P06783	470 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	HYM1	P32464	399 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	PET127	P32606	800 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	SDS22	P36047	338 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	CAF4	P36130	643 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	ECM13	P38195	257 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	YBL036C	P38197	257 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	CST26	P38226	397 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	POP4	P38336	279 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	PCA1	P38360	1216 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	ORC6	P38826	435 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	END3	P39013	349 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	ECM10	P39987	644 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	YIL089W	P40500	205 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	TIR3	P40552	269 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	HXT9	P40885	567 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	GUF1	P46943	645 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	MNN5	P46982	586 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	TIM54	P47045	478 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	HOC1	P47124	396 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	SAP4	P53036	818 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	TPN1	P53099	579 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	NUT1	P53114	1132 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	YGR026W	P53217	278 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	HXT15	P54854	567 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	YET2	Q04210	160 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	YLR271W	Q06152	274 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	SPH1	Q06160	661 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	MLH3	Q12083	715 aa		4.26	□□□□□ -1.73

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