RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	SRB6	P32570	121 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	CIN2	P46670	268 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	BOP2	Q06150	570 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YLR036C	Q07986	203 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YOR223W	Q12015	292 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MEI4	P29467	408 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.75	□□□□□ -1.97	not detected
TOM1	YDR457W	SGE1	P33335	543 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	KDX1	P36005	433 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	TVP38	P36164	337 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	CHL4	P38907	458 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	BUR6	P40096	142 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	FIG4	P42837	879 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ARA2	Q04212	335 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	FRQ1	Q06389	190 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	THI3	Q07471	609 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	TMA16	Q08687	178 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SVS1	Q12254	260 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MED11	Q99278	115 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SCC2	Q04002	1493 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	CCP1	P00431	361 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MNE1	P24720	663 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	FMP23	P38231	175 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YER186C	P40101	306 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	JJJ3	P47138	172 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SCY1	P53009	804 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	NUP49	Q02199	472 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SFG1	Q12507	346 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MET2	P08465	486 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	DAP2	P18962	818 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YKU70	P32807	602 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	TKL2	P33315	681 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	FAA2	P39518	744 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	GCD10	P41814	478 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PRM15	Q03262	622 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	DAL7	P21826	554 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PET10	P36139	283 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ETR1	P38071	380 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	JLP2	P40206	208 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	CIT3	P43635	486 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	BFA1	P47113	574 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	REG1	Q00816	1014 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	CCE1	Q03702	353 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	CDC123	Q05791	360 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	BUR2	Q05949	395 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YOL131W	Q08270	108 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	TY3A-G	Q12173	290 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MHF2	Q3E829	80 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	TY3A-I	Q99219	290 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MCM1	P11746	286 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	DAL80	P26343	269 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ELM1	P32801	640 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YHR210C	P38893	341 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YJL193W	P39542	402 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	TLG1	Q03322	224 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ALG1	P16661	449 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SPR1	P32603	445 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SPT10	P35208	640 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	OCT1	P35999	772 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	VID24	P38263	362 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	STL1	P39932	569 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	GUP1	P53154	560 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SKS1	Q12505	502 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PBS2	P08018	668 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	CAF120	P53836	1060 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MRPL1	Q04599	285 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	FCY22	Q12119	530 aa		2.74	□□□□□ -1.97

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