RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rhbdl3P58873 404 aa6.78□□□□□ -1.32
Trappc1-201ENSMUST00000060956 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cep131Q62036 1060 aa6.78□□□□□ -1.32
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CrkQ64010 304 aa6.78□□□□□ -1.32
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cep70Q6IQY5 616 aa6.78□□□□□ -1.32
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ube2q1Q7TSS2 422 aa6.78□□□□□ -1.32
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ubap2lQ80X50 1107 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
Trappc1-201ENSMUST00000060956 NrdcQ8BHG1 1161 aa6.78□□□□□ -1.32
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gpr20Q8BYC4 358 aa6.78□□□□□ -1.32
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zswim3Q8CFL8 695 aa6.78□□□□□ -1.32
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Usp33Q8R5K2 909 aa6.78□□□□□ -1.32
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Atxn3Q9CVD2 355 aa6.78□□□□□ -1.32
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mrpl12Q9DB15 201 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cry2Q9R194 592 aa6.78□□□□□ -1.32
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bub1bQ9Z1S0 1052 aa6.78□□□□□ -1.32
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CpdO89001 1377 aa6.78□□□□□ -1.32
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Unc80Q8BLN6 3261 aa6.77□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pramef17A2ASJ1 475 aa6.77□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fam46aD3Z5S8 447 aa6.77□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ly6c1P0CW02 131 aa6.77□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ly6c2P0CW03 131 aa6.77□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gpr182P43142 395 aa6.77□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tm4sf1Q64302 202 aa6.77□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Znf629Q6A085 867 aa6.77□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Adamtsl4Q80T21 1036 aa6.77□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Phf20Q8BLG0 1010 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PpatQ8CIH9 517 aa6.77□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prkag2Q91WG5 566 aa6.77□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Txnrd3Q99MD6 652 aa6.77□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa6.77□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sertad1Q9JL10 236 aa6.77□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gyg1Q9R062 333 aa6.77□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rbm6S4R1W5 1118 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sbf1Q6ZPE2 1867 aa6.77□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gon4lQ9DB00 2260 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lbhd1A0A087WPA0 259 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 DgkiD3YWQ0 1071 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rfpl4bJ3QPR6 266 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Neurod4O09105 330 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zfpm1O35615 995 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 DcxO88809 366 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Esx1O88933 382 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Klf16P58334 251 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 A530084C06RikQ3UTW2 186 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dpp9Q8BVG4 862 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Snx17Q8BVL3 470 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fsd2Q8BZ52 692 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dlk2Q8K1E3 382 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zcchc14Q8VIG0 956 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Borcs6Q9D6W8 360 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Znfx1Q8R151 1909 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 SynrgQ5SV85 1306 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prss51A0A286YDY8 319 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Btnl4A2CG29 586 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm19402J3QJV4 266 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Wisp1O54775 367 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hoxd10P28359 340 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zap70P43404 618 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mmp20P57748 482 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fam109bQ14B98 259 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rftn1Q6A0D4 554 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pcdhga7Q6DD96 935 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pear1Q8VIK5 1034 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Itm2cQ91VK4 269 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ncoa5Q91W39 579 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Polr3dQ91WD1 398 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Elp3Q9CZX0 547 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Echdc1Q9D9V3 322 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Flvcr1B2RXV4 560 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pnmal2G3X9N3 661 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc6a20bO88575 635 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 LtkP08923 888 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 GabrdP22933 449 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sox1P53783 391 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ezh1P70351 747 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Atp9bP98195 1146 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Plekhf1Q3TB82 279 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccdc84Q4VA36 332 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trim46Q7TNM2 759 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pof1bQ8K4L4 587 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 FlcnQ8QZS3 579 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Acot7Q91V12 381 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Golga2Q921M4 999 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rfc4Q99J62 364 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Snw1Q9CSN1 536 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Znf687Q9D2D7 1237 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Galntl5Q9D4M9 431 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 DcpsQ9DAR7 338 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rad9aQ9Z0F6 389 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sept3Q9Z1S5 350 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Plcg1Q62077 1302 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nup98Q6PFD9 1816 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm13040A2A8C4 496 aa6.73□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CerklA2AQH1 525 aa6.73□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ankrd63A2ARS0 390 aa6.73□□□□□ -1.33
Trappc1-201ENSMUST00000060956 UprtB1AVZ0 310 aa6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.4 ms