Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5S8

Fam46a, Family with sequence similarity 46, member A, mousemouse

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46aD3Z5S8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Fam46aD3Z5S8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Fam46aD3Z5S8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Fam46aD3Z5S8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Fam46aD3Z5S8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Fam46aD3Z5S8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Fam46aD3Z5S8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Fam46aD3Z5S8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Fam46aD3Z5S8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Fam46aD3Z5S8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Fam46aD3Z5S8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Fam46aD3Z5S8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Fam46aD3Z5S8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Fam46aD3Z5S8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Fam46aD3Z5S8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Fam46aD3Z5S8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Fam46aD3Z5S8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Fam46aD3Z5S8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Fam46aD3Z5S8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Fam46aD3Z5S8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Fam46aD3Z5S8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fam46aD3Z5S8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fam46aD3Z5S8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fam46aD3Z5S8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fam46aD3Z5S8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fam46aD3Z5S8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fam46aD3Z5S8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Fam46aD3Z5S8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fam46aD3Z5S8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fam46aD3Z5S8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fam46aD3Z5S8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fam46aD3Z5S8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fam46aD3Z5S8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fam46aD3Z5S8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Fam46aD3Z5S8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fam46aD3Z5S8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fam46aD3Z5S8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fam46aD3Z5S8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Fam46aD3Z5S8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fam46aD3Z5S8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fam46aD3Z5S8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fam46aD3Z5S8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fam46aD3Z5S8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Fam46aD3Z5S8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Fam46aD3Z5S8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fam46aD3Z5S8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fam46aD3Z5S8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fam46aD3Z5S8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fam46aD3Z5S8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fam46aD3Z5S8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fam46aD3Z5S8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fam46aD3Z5S8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fam46aD3Z5S8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fam46aD3Z5S8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fam46aD3Z5S8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Fam46aD3Z5S8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Fam46aD3Z5S8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fam46aD3Z5S8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam46aD3Z5S8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fam46aD3Z5S8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fam46aD3Z5S8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam46aD3Z5S8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fam46aD3Z5S8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fam46aD3Z5S8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fam46aD3Z5S8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fam46aD3Z5S8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fam46aD3Z5S8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fam46aD3Z5S8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Fam46aD3Z5S8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fam46aD3Z5S8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fam46aD3Z5S8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Fam46aD3Z5S8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fam46aD3Z5S8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Fam46aD3Z5S8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fam46aD3Z5S8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Fam46aD3Z5S8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fam46aD3Z5S8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fam46aD3Z5S8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam46aD3Z5S8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Fam46aD3Z5S8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Fam46aD3Z5S8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fam46aD3Z5S8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fam46aD3Z5S8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam46aD3Z5S8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fam46aD3Z5S8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Fam46aD3Z5S8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fam46aD3Z5S8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fam46aD3Z5S8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Fam46aD3Z5S8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fam46aD3Z5S8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fam46aD3Z5S8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fam46aD3Z5S8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fam46aD3Z5S8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fam46aD3Z5S8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fam46aD3Z5S8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Fam46aD3Z5S8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Fam46aD3Z5S8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fam46aD3Z5S8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Fam46aD3Z5S8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam46aD3Z5S8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
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