Protein–RNA interactions for Protein: A2AQH1

Cerkl, Ceramide kinase-like, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CerklA2AQH1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
CerklA2AQH1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CerklA2AQH1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CerklA2AQH1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CerklA2AQH1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CerklA2AQH1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
CerklA2AQH1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CerklA2AQH1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
CerklA2AQH1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
CerklA2AQH1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CerklA2AQH1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CerklA2AQH1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CerklA2AQH1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CerklA2AQH1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CerklA2AQH1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CerklA2AQH1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CerklA2AQH1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CerklA2AQH1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CerklA2AQH1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CerklA2AQH1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CerklA2AQH1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CerklA2AQH1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CerklA2AQH1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CerklA2AQH1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CerklA2AQH1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CerklA2AQH1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CerklA2AQH1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CerklA2AQH1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CerklA2AQH1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CerklA2AQH1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CerklA2AQH1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CerklA2AQH1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CerklA2AQH1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CerklA2AQH1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CerklA2AQH1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CerklA2AQH1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CerklA2AQH1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CerklA2AQH1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CerklA2AQH1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CerklA2AQH1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CerklA2AQH1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CerklA2AQH1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CerklA2AQH1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CerklA2AQH1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CerklA2AQH1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CerklA2AQH1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CerklA2AQH1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CerklA2AQH1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CerklA2AQH1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CerklA2AQH1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CerklA2AQH1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CerklA2AQH1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CerklA2AQH1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CerklA2AQH1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CerklA2AQH1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CerklA2AQH1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CerklA2AQH1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CerklA2AQH1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CerklA2AQH1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CerklA2AQH1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CerklA2AQH1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CerklA2AQH1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CerklA2AQH1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CerklA2AQH1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CerklA2AQH1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CerklA2AQH1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CerklA2AQH1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CerklA2AQH1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CerklA2AQH1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CerklA2AQH1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CerklA2AQH1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CerklA2AQH1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CerklA2AQH1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CerklA2AQH1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CerklA2AQH1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CerklA2AQH1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CerklA2AQH1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CerklA2AQH1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CerklA2AQH1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CerklA2AQH1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CerklA2AQH1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CerklA2AQH1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CerklA2AQH1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CerklA2AQH1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CerklA2AQH1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CerklA2AQH1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CerklA2AQH1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CerklA2AQH1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CerklA2AQH1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CerklA2AQH1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CerklA2AQH1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CerklA2AQH1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CerklA2AQH1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CerklA2AQH1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CerklA2AQH1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CerklA2AQH1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CerklA2AQH1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CerklA2AQH1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CerklA2AQH1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CerklA2AQH1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms