Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45.06■■■■■ 4.8
Hoxd10P28359 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Hoxd10P28359 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Hoxd10P28359 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
Hoxd10P28359 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
Hoxd10P28359 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Hoxd10P28359 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Hoxd10P28359 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Hoxd10P28359 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
Hoxd10P28359 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Hoxd10P28359 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Hoxd10P28359 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Hoxd10P28359 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Hoxd10P28359 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Hoxd10P28359 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Hoxd10P28359 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Hoxd10P28359 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Hoxd10P28359 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Hoxd10P28359 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Hoxd10P28359 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Hoxd10P28359 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Hoxd10P28359 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Hoxd10P28359 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Hoxd10P28359 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Hoxd10P28359 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Hoxd10P28359 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Hoxd10P28359 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Hoxd10P28359 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Hoxd10P28359 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Hoxd10P28359 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Hoxd10P28359 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Hoxd10P28359 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Hoxd10P28359 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Hoxd10P28359 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Hoxd10P28359 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Hoxd10P28359 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Hoxd10P28359 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Hoxd10P28359 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Hoxd10P28359 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Hoxd10P28359 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Hoxd10P28359 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Hoxd10P28359 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Hoxd10P28359 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Hoxd10P28359 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Hoxd10P28359 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Hoxd10P28359 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Hoxd10P28359 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Hoxd10P28359 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Hoxd10P28359 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Hoxd10P28359 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Hoxd10P28359 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Hoxd10P28359 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Hoxd10P28359 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Hoxd10P28359 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Hoxd10P28359 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Hoxd10P28359 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Hoxd10P28359 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Hoxd10P28359 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Hoxd10P28359 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Hoxd10P28359 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Hoxd10P28359 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Hoxd10P28359 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Hoxd10P28359 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Hoxd10P28359 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Hoxd10P28359 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Hoxd10P28359 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Hoxd10P28359 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Hoxd10P28359 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Hoxd10P28359 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Hoxd10P28359 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Hoxd10P28359 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Hoxd10P28359 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Hoxd10P28359 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Hoxd10P28359 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Hoxd10P28359 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Hoxd10P28359 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Hoxd10P28359 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Hoxd10P28359 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Hoxd10P28359 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Hoxd10P28359 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Hoxd10P28359 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Hoxd10P28359 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Hoxd10P28359 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Hoxd10P28359 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Hoxd10P28359 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Hoxd10P28359 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Hoxd10P28359 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Hoxd10P28359 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Hoxd10P28359 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Hoxd10P28359 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Hoxd10P28359 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Hoxd10P28359 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Hoxd10P28359 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Hoxd10P28359 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Hoxd10P28359 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Hoxd10P28359 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Hoxd10P28359 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Hoxd10P28359 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Hoxd10P28359 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Hoxd10P28359 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.7 ms