RNA–Protein interactions for RNA: tS(GCU)Q1

tS(GCU)Q1, Transcript of Mitochondrial serine tRNA (tRNA-Ser), yeastyeast

Gene tS(GCU)Q1, Length 86 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HFI1Q12060 488 aa-0.14□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HOS1Q12214 470 aa-0.14□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YCK1P23291 538 aa-0.15□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ARB1P40024 610 aaKnown RBP-0.15□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 AXL1P40851 1208 aa-0.15□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YGR153WP48238 217 aa-0.15□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP-0.15□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 AIM32Q04689 311 aa-0.15□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NGL1Q08213 363 aaKnown RBP-0.15□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP-0.15□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CHO1P08456 276 aa-0.16□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 KRS1P15180 591 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SEC62P21825 274 aa-0.16□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SAC1P32368 623 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PTK1P36002 662 aaPredicted RBP-0.16□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PHO90P39535 881 aa-0.16□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YIL067CP40514 678 aa-0.16□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BSC5P53755 489 aa-0.16□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PDH1Q12428 516 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 APM4Q99186 491 aa-0.16□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 URA3P03962 267 aa-0.17□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CPR1P14832 162 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SAG1P20840 650 aa-0.17□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VPS17P32913 551 aa-0.17□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SHP1P34223 423 aa-0.17□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CKB2P38930 258 aa-0.17□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RSN1Q03516 953 aa-0.17□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VAM6Q07468 1049 aa-0.17□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TYR1P20049 452 aa-0.18□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YME2P32843 850 aa-0.18□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ARA1P38115 344 aa-0.18□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MRPS9P38120 278 aa-0.18□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SRP68P38687 599 aaKnown RBP-0.18□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VFA1P40080 203 aa-0.18□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MSY1P48527 492 aa-0.18□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MNT2P53059 558 aa-0.18□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SKY1Q03656 742 aa-0.18□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MAS2P11914 482 aa-0.19□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RAP1P11938 827 aa-0.19□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PET123P17558 318 aa-0.19□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CLB2P24869 491 aa-0.19□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MSH2P25847 964 aa-0.19□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PIM1P36775 1133 aa-0.19□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ADE17P38009 592 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DUG2P38149 878 aa-0.19□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SEO1P39709 593 aa-0.19□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YIL060WP40519 144 aa-0.19□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YGR079WP53249 370 aa-0.19□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ADE16P54113 591 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ORC1P54784 914 aaPredicted RBP-0.19□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 LPD1P09624 499 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 OLE1P21147 510 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PUT3P25502 979 aaPredicted RBP-0.2□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RAD16P31244 790 aa-0.2□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PET309P32522 965 aaPredicted RBP-0.2□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MRP4P32902 394 aa-0.2□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TIM17P39515 158 aa-0.2□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YFL067WP43537 175 aa-0.2□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NBP1P52919 319 aaPredicted RBP-0.2□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SAM50P53969 484 aa-0.2□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YOR378WQ08902 515 aa-0.2□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TEF1P02994 458 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PCT1P13259 424 aa-0.21□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SDH3P33421 198 aa-0.21□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ECM15P35195 104 aa-0.21□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ALG8P40351 577 aa-0.21□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PKP2P53170 491 aa-0.21□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YTP1P53584 459 aa-0.21□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NRM1P53718 249 aa-0.21□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PEX25Q02969 394 aa-0.21□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TRS31Q03337 283 aa-0.21□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CSR1Q06705 408 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YLR001CQ07895 862 aa-0.21□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 THI20Q08224 551 aa-0.21□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ESA1Q08649 445 aa-0.21□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CDC53Q12018 815 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.21□□□□□ -2.44not detected
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NAM2P11325 894 aa-0.22□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BIK1P11709 440 aa-0.22□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RNA14P25298 677 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CMK1P27466 446 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GAC1P28006 793 aa-0.22□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SHO1P40073 367 aa-0.22□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MGS1P40151 587 aa-0.22□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 IRC5P43610 853 aa-0.22□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FLC3P53121 802 aa-0.22□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 IRC15Q02733 499 aa-0.22□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YMR087WQ04299 284 aa-0.22□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HRI1Q05905 244 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RDR1Q08904 546 aa-0.22□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BAG7Q12128 409 aa-0.22□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 APC2Q12440 853 aa-0.22□□□□□ -2.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HEM15P16622 393 aa-0.23□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.23□□□□□ -2.45not detected
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SGV1P23293 657 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YCR022CP25620 114 aa-0.23□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 KKQ8P36004 724 aa-0.23□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 UBP13P38187 747 aa-0.23□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 34.7 ms