RNA–Protein interactions for RNA: YOR032C

HMS1, Transcript of bHLH protein with similarity to myc-family transcription factors, yeast

Gene HMS1, Length 1,305 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HMS1	YOR032C	YLR287C	Q05881	355 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	PET111	P08468	800 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	CBS1	P14066	229 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	OCA4	P25366	362 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	YIH1	P25637	258 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	UIP3	P39547	235 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	RGI2	P40188	164 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	PKP1	P40530	394 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	YML037C	Q03703	340 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	TPO3	Q06451	622 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	CIR2	Q08822	631 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	YLR049C	Q12110	428 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HMS1	YOR032C	FOB1	O13329	566 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	ARG3	P05150	338 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	CKA1	P15790	372 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	ADH7	P25377	361 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	REG2	P38232	338 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	AFG3	P39925	761 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	SMC3	P47037	1230 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	TAF11	Q04226	346 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	IRC3	Q06683	689 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	YEH1	Q07804	573 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	INP53	Q12271	1107 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	SCM3	Q12334	223 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	SPE4	Q12455	300 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	SPE2	P21182	396 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	YCR006C	P25350	157 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	ERV46	P39727	415 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	YFR020W	P43600	232 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	DIA3	P52290	468 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	LCL3	P53153	274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	YGR066C	P53242	292 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	ATP23	P53722	227 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	ORM2	Q06144	216 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	YKL050C	P35736	922 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	SPO22	P40511	975 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	CDC1	P40986	491 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	VTC2	P43585	828 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	IRC7	P43623	340 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	IRC8	P47046	822 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	NNF2	P53253	936 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	ZDS2	P54786	942 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	PFA5	Q03289	374 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	PDR8	Q06149	701 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	YLR455W	Q06188	304 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	OSW1	Q08692	278 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	YPL272C	Q08984	517 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	YLR111W	Q12528	110 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	RAP1	P11938	827 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	ORC2	P32833	620 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	OCT1	P35999	772 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	ARN1	P38731	627 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	VID30	P53076	958 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	MCH4	Q08268	501 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	APL4	Q12028	832 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	ATG9	Q12142	997 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	YPT6	Q99260	215 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	MET17	P06106	444 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
HMS1	YOR032C	CHO1	P08456	276 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	ERG11	P10614	530 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	RED1	P14291	827 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	NPL6	P32832	435 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	MNN2	P38069	597 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	YJL107C	P42947	387 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	FAR3	P46671	204 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	YGR127W	P53275	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	MAK10	Q02197	733 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	SFI1	Q12369	946 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	SRO77	P38163	1010 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	ELO1	P39540	310 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	EFM6	P53970	246 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HMS1	YOR032C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68

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