RNA–Protein interactions for RNA: YLR066W

SPC3, Transcript of Subunit of signal peptidase complex, yeast

Gene SPC3, Length 555 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPC3	YLR066W	POL4	P25615	582 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	PEP3	P27801	918 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	NPL6	P32832	435 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	TAX4	P47030	604 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	DIA3	P52290	468 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	YPR003C	P53394	754 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	YEH1	Q07804	573 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	YPL272C	Q08984	517 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	SPE4	Q12455	300 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	FOB1	O13329	566 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	ARG3	P05150	338 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	PET111	P08468	800 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	CKA1	P15790	372 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	YKL050C	P35736	922 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	BUR6	P40096	142 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	CIN1	P40987	1014 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	YFR020W	P43600	232 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	ATG9	Q12142	997 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	SFI1	Q12369	946 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.73	□□□□□ -1.65	not detected
SPC3	YLR066W	RED1	P14291	827 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	SPE2	P21182	396 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	REG2	P38232	338 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	CCT6	P39079	546 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	ERV46	P39727	415 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	SPO22	P40511	975 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	VTC2	P43585	828 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	ORM2	Q06144	216 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	TPO3	Q06451	622 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	OCT1	P35999	772 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	ARN1	P38731	627 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	FAR3	P46671	204 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	VID30	P53076	958 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	YGR127W	P53275	312 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	ATP23	P53722	227 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	OSW1	Q08692	278 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	YPT6	Q99260	215 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	BNR1	P40450	1375 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	RAP1	P11938	827 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	ROX1	P25042	368 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	NFU1	P32860	256 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	AFG3	P39925	761 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	MET28	P40573	187 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	EFM6	P53970	246 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	ZDS2	P54786	942 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	MAK10	Q02197	733 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	PDR8	Q06149	701 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	MCH4	Q08268	501 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	APL4	Q12028	832 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	GPA1	P08539	472 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	STE50	P25344	346 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	ORC2	P32833	620 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	FLO10	P36170	1169 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	MNN2	P38069	597 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	SRO77	P38163	1010 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	MUM2	P38236	366 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	YJL107C	P42947	387 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	IRC7	P43623	340 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	LCL3	P53153	274 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	PFA5	Q03289	374 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	BUD7	Q08754	746 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	CLB2	P24869	491 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	UBP11	P36026	717 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	ELO1	P39540	310 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	IRC8	P47046	822 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SPC3	YLR066W	NNF2	P53253	936 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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