RNA–Protein interactions for RNA: YGL103W

RPL28, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L28, yeast

Gene RPL28, Length 450 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL28	YGL103W	IMA1	P53051	589 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	PEX31	P53203	462 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	YNR063W	P53749	607 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	RSN1	Q03516	953 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	URC2	Q04411	772 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	ARP9	Q05123	467 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	REH1	Q06709	432 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	UIP4	Q08926	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	MDY2	Q12285	212 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	GPR1	Q12361	961 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	ARG3	P05150	338 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	PET122	P10355	254 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	INO1	P11986	533 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	CBS2	P14905	389 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	PHO81	P17442	1178 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	YSP3	P25036	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	PHO87	P25360	923 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	PEX3	P28795	441 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	BEM3	P32873	1128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	CSE1	P33307	960 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	SKG1	P36169	355 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	YPK3	P38070	525 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	IST2	P38250	946 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	SLI15	P38283	698 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	VPS29	P38759	282 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	YHR078W	P38799	552 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	FAD1	P38913	306 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	XDJ1	P39102	459 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	DSS1	P39112	969 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	YJR061W	P40355	935 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	YJL070C	P40361	888 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	IMA5	P40884	581 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	GLG2	P47011	380 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	RTT101	P47050	842 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	MPS3	P47069	682 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	KEL2	P50090	882 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	GTR2	P53290	341 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	KTR6	P54070	446 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	ECM9	Q02202	377 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	RMI1	Q02685	241 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	TAF12	Q03761	539 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	TRM12	Q04235	462 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	PEX12	Q04370	399 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	YMR321C	Q04898	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	FMP45	Q07651	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	SLD7	Q08457	257 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	UBX3	Q12229	455 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	SUC2	P00724	532 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	HEM2	P05373	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	TPK1	P06244	397 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	DMC1	P25453	334 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
RPL28	YGL103W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	BEM1	P29366	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	NTG1	P31378	399 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	RGT1	P32862	1170 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
RPL28	YGL103W	YBR241C	P38142	488 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	PRM9	P39551	298 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	SWD1	P39706	426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	YEL028W	P39989	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	KRE29	P40026	464 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	YEN1	P40028	759 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	PSF2	P40359	213 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	COA1	P40452	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	EFM3	P47163	339 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	YJR154W	P47181	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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