RNA–Protein interactions for RNA: YFR049W

YMR31, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene YMR31, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR31	YFR049W	BTN2	P53286	410 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	JJJ1	P53863	590 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	IPI3	P53877	555 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	YNL092W	P53934	400 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	RSM28	Q03430	361 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	WAR1	Q03631	944 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	YLR345W	Q06137	509 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	ATG29	Q12092	213 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	AVL9	Q12500	764 aa		2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	CLB1	P24868	471 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	YSP3	P25036	478 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	YCR051W	P25631	222 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	ANP1	P32629	500 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	TFB1	P32776	642 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	PMT1	P33775	817 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	MRX1	P40050	688 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	ALG5	P40350	334 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	PET130	P47065	347 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	COQ6	P53318	479 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	VPS9	P54787	451 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	INA17	Q02888	182 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	PLM2	Q04383	521 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	HIF1	Q12373	385 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	AFI1	Q99222	893 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	SGS1	P35187	1447 aa		2.76	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	THI80	P35202	319 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	CMC1	P36064	111 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	YHL017W	P38745	532 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	CCT6	P39079	546 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	PTR3	P43606	678 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	NNF2	P53253	936 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	MAK10	Q02197	733 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	OAZ1	Q02803	292 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	RAD33	Q04231	177 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	ROY1	Q04847	553 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	YDR286C	Q05530	114 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	YOR389W	Q08912	624 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	YPL191C	Q08930	360 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	LCB4	Q12246	624 aa		2.75	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	APE1	P14904	514 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.74	□□□□□ -1.97	not detected
YMR31	YFR049W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	SPE2	P21182	396 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	APN1	P22936	367 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	ADH7	P25377	361 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	ERV1	P27882	189 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	SYN8	P31377	255 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	YME1	P32795	747 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	YBR144C	P34215	104 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	YKL100C	P34248	587 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	BDH2	P39713	417 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	ECM10	P39987	644 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	ASG1	P40467	964 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	HXT14	P42833	540 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	YFL015C	P43578	164 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	YFR020W	P43600	232 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	AVT1	P47082	602 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	TWF1	P53250	332 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	MUK1	Q02866	612 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	PEX25	Q02969	394 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	ARO10	Q06408	635 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	FMP45	Q07651	309 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	PCL8	Q08966	492 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	RLM1	Q12224	676 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YMR31	YFR049W	INP53	Q12271	1107 aa		2.74	□□□□□ -1.97

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