RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	YPR109W	Q06104	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	ESA1	Q08649	445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	DDC1	Q08949	612 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YDL176W	Q12027	708 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	ULA1	Q12059	462 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YOR342C	Q12182	319 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	PSY3	Q12318	242 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	CCP1	P00431	361 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	HEM2	P05373	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YSP3	P25036	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YIH1	P25637	258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	MET4	P32389	672 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	AIM26	P32858	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	ASH1	P34233	588 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	TOM20	P35180	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	MRPL7	P36519	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YHL012W	P38709	493 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YEN1	P40028	759 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YIL089W	P40500	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	MRX6	P48564	524 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SCS3	P53012	380 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YNL095C	P53932	642 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	EFM6	P53970	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	CDC14	Q00684	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	STP1	Q00947	519 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	ECM9	Q02202	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YKR005C	Q02203	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	PET117	Q02771	107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	ENT2	Q05785	613 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YCS4	Q06156	1176 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YEH2	Q07950	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	UAF30	Q08747	228 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	GPM2	Q12008	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	MDY2	Q12285	212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	COR1	P07256	457 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SPE1	P08432	466 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	APE1	P14904	514 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	DMC1	P25453	334 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	ADY2	P25613	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	DAL1	P32375	460 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	BIO2	P32451	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	NGG1	P32494	702 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	KAR9	P32526	644 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	TKL2	P33315	681 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SEC66	P33754	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	FRE2	P36033	711 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SRL3	P36167	246 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YBR138C	P38277	524 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	RIM11	P38615	370 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	PIK1	P39104	1066 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SEO1	P39709	593 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	MGS1	P40151	587 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	ELO3	P40319	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	COA1	P40452	197 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	PRM2	P40534	656 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	MSS2	P40990	351 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	CNN1	P43618	361 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	GUF1	P46943	645 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	MPS3	P47069	682 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	GTR2	P53290	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
UBX7	YBR273C	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YNL033W	P53964	284 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YNL019C	P53975	284 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	RSC4	Q02206	625 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SPP2	Q02521	185 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	MUK1	Q02866	612 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	HRD3	Q05787	833 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	NDL1	Q06568	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	PMT7	Q06644	662 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YVC1	Q12324	675 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	ARP7	Q12406	477 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SEM1	O94742	89 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	REP1	P03871	373 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	MOD5	P07884	428 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	TOP3	P13099	656 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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