RNA–Protein interactions for RNA: tS(GCU)Q1

tS(GCU)Q1, Transcript of Mitochondrial serine tRNA (tRNA-Ser), yeastyeast

Gene tS(GCU)Q1, Length 86 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VID28P40547 921 aa-0.04□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HXT9P40885 567 aa-0.04□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RET2P43621 546 aa-0.04□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NPA3P47122 385 aa-0.04□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MSO1P53604 210 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HHF1P02309 103 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HEM2P05373 342 aa-0.05□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CDC26P14724 124 aa-0.05□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.05□□□□□ -2.42not detected
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPB8P20436 146 aa-0.05□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RER1P25560 188 aa-0.05□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FUN19P28003 413 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PAH1P32567 862 aa-0.05□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SAC6P32599 642 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ELP3Q02908 557 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MRC1P25588 1096 aa-0.06□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CWH43P25618 953 aa-0.06□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ARO2P28777 376 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 IME2P32581 645 aa-0.06□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SEF1P34228 1148 aa-0.06□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TUL1P36096 758 aa-0.06□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YGP1P38616 354 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YER130CP39959 443 aa-0.06□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ECM9Q02202 377 aa-0.06□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 WTM1Q12363 437 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 STE50P25344 346 aa-0.07□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SPC34P36131 295 aa-0.07□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 STV1P37296 890 aa-0.07□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPT35P38815 214 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YGL081WP53156 320 aa-0.07□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 WSC2P53832 503 aa-0.07□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VPS64Q03944 604 aa-0.07□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ECM11Q04110 302 aa-0.07□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 COX1P00401 534 aa-0.08□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RRN11Q04712 507 aa-0.08□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CRF1Q04930 467 aa-0.08□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PBA1Q05778 276 aa-0.08□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CDC45Q08032 650 aa-0.08□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ERV2Q12284 196 aa-0.08□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ERR1P0CX10 437 aa-0.09□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ERR2P0CX11 437 aa-0.09□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ACH1P32316 526 aa-0.09□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YNK1P36010 153 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YHR131CP38835 850 aa-0.09□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FUN12P39730 1002 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YTA12P40341 825 aa-0.09□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TMA108P40462 946 aa-0.09□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YGL082WP53155 381 aa-0.09□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NUP100Q02629 959 aa-0.09□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RBA50Q04418 439 aa-0.09□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ECM7Q06200 448 aa-0.09□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YDL218WQ07629 317 aa-0.09□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FMP45Q07651 309 aa-0.09□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPQ1Q12010 308 aa-0.09□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 INP53Q12271 1107 aa-0.09□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PDE1P22434 369 aa-0.1□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RFC1P38630 861 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BUD16P39988 312 aa-0.1□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YJR120WP47157 116 aa-0.1□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YDR109CQ04585 715 aa-0.1□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FMT1P32785 401 aa-0.11□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PHD1P36093 366 aa-0.11□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TYS1P36421 394 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 REE1P40893 198 aa-0.11□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PFS2P42841 465 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VHS1Q03785 461 aa-0.11□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SUL2Q12325 893 aa-0.11□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ARP6Q12509 438 aa-0.11□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YBR255C-AQ3E776 120 aa-0.11□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ATR1P13090 542 aa-0.12□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TKL1P23254 680 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CDC60P26637 1090 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PRE2P30656 287 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CBF2P32504 956 aa-0.12□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 OAF3P36023 863 aa-0.12□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PMU1P36069 295 aa-0.12□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FAT1P38225 669 aa-0.12□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VID24P38263 362 aa-0.12□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HXT6P39003 570 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HXT7P39004 570 aa-0.12□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NPR2P39923 615 aa-0.12□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 EMP65P40085 556 aa-0.12□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PFA5Q03289 374 aa-0.12□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MSS11Q03825 758 aa-0.12□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP-0.12□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MRPL35Q06678 367 aa-0.12□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 AAD4Q07747 329 aa-0.12□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VPS5Q92331 675 aa-0.12□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HXT4P32467 576 aa-0.13□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SIP2P34164 415 aaKnown RBP-0.13□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 UGO1Q03327 502 aa-0.13□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YHM2Q04013 314 aa-0.13□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ENT4Q07872 247 aa-0.13□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SPO7P18410 259 aa-0.14□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MCM4P30665 933 aaKnown RBP-0.14□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NMD2P38798 1089 aaKnown RBP-0.14□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PHM8P40025 321 aa-0.14□□□□□ -2.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YNL034WP53963 612 aa-0.14□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.8 ms