RNA–Protein interactions for RNA: YOL083W

ATG34, Transcript of Receptor protein involved in selective autophagy during starvation, yeast

Gene ATG34, Length 1,239 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG34	YOL083W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	VID27	P40157	782 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	YIL024C	P40543	189 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	CBK1	P53894	756 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	STP1	Q00947	519 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	PDR8	Q06149	701 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	NUS1	Q12063	375 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	PET111	P08468	800 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	PTP1	P25044	335 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	LHS1	P36016	881 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	ALY1	P36117	915 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	ECM10	P39987	644 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	MRX1	P40050	688 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	IME4	P41833	600 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	NET1	P47035	1189 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	PIG1	Q06216	648 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	MCH4	Q08268	501 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	NKP1	Q12493	238 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	YJR061W	P40355	935 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	CFD1	P40558	293 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	SIP4	P46954	829 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	RSM28	Q03430	361 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	NBP2	Q12163	236 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	CHO1	P08456	276 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	CNA1	P23287	553 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	YCR006C	P25350	157 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	CDC15	P27636	974 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	PXL1	P36166	706 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	VPS41	P38959	992 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	SLZ1	P40167	298 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	CTK2	P46962	323 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	AAD10	P47182	288 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	INN1	P53901	409 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	VTC3	Q02725	835 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	MUB1	Q03162	620 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	ENT4	Q07872	247 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	RRI1	Q12468	440 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	STE50	P25344	346 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	SWE1	P32944	819 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	YFR020W	P43600	232 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	BSC5	P53755	489 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	PFA5	Q03289	374 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	CHS3	P29465	1165 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	FLO5	P38894	1075 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	JHD1	P40034	492 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	MNT3	P40549	630 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	YSA1	Q01976	231 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	YKU80	Q04437	629 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	CDC16	P09798	840 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	PAH1	P32567	862 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	ESL2	P36168	1195 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	YEL068C	P39977	110 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	PKP1	P40530	394 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	YNL144C	P53907	740 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	INA17	Q02888	182 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	SWF1	Q04629	336 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	FRE3	Q08905	711 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	ATG9	Q12142	997 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	SKM1	Q12469	655 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	RAP1	P11938	827 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	LYS14	P40971	790 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	YPT11	P48559	417 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	UBP8	P50102	471 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	ASI1	P54074	624 aa		4.12	□□□□□ -1.75

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