RNA–Protein interactions for RNA: YLR265C

NEJ1, Transcript of Protein involved in regulation of nonhomologous end joining, yeast

Gene NEJ1, Length 1,029 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NEJ1	YLR265C	BZZ1	P38822	633 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NEJ1	YLR265C	RTT103	Q05543	409 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NEJ1	YLR265C	TAH18	Q12181	623 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NEJ1	YLR265C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	MSH1	P25846	959 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	EXO84	P38261	753 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	IML2	P47031	731 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	ATP4	P05626	244 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	SMA1	Q02651	245 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	ZAP1	P47043	880 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	SWA2	Q06677	668 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	MGR1	P25573	417 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	YHL041W	P38730	149 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	PUG1	P40100	303 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	YNL181W	P53878	407 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	PFA5	Q03289	374 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	SWT1	Q12104	458 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	PET111	P08468	800 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	RAD24	P32641	659 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	HXT9	P40885	567 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	ERR3	P42222	437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	ATG27	P46989	271 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	CUL3	P53202	744 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	TRS130	Q03660	1102 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	CLB4	P24871	460 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	PDR3	P33200	976 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	YPK3	P38070	525 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	VAM6	Q07468	1049 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	BAR1	P12630	587 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	YNL234W	P53857	426 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	ARP10	Q04549	284 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	MCP2	Q06567	569 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	TIP41	Q12199	356 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	NYV1	Q12255	253 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NEJ1	YLR265C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	SGF73	P53165	657 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	MAK10	Q02197	733 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	EKI1	Q03764	534 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	YJL070C	P40361	888 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	CRN1	Q06440	651 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	BSC1	Q12140	328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	PHO81	P17442	1178 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	LHS1	P36016	881 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	CTK2	P46962	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	SPO16	P17122	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	ACA1	P39970	489 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	MRX1	P40050	688 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	SWP82	P43554	623 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	CRZ1	P53968	678 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	CIA1	Q05583	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	YML002W	P0CF17	737 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	RTS2	P40962	232 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	YTP1	P53584	459 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	RSF1	Q05043	376 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	YOL057W	Q08225	711 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	PMS1	P14242	873 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	CLB2	P24869	491 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	YCL049C	P25577	312 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	YOX1	P34161	385 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	NUP120	P35729	1037 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	RIM2	P38127	377 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NEJ1	YLR265C	EDE1	P34216	1381 aa		4.53	□□□□□ -1.69
NEJ1	YLR265C	RAP1	P11938	827 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEJ1	YLR265C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NEJ1	YLR265C	MSM1	P22438	575 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEJ1	YLR265C	TRS65	P32893	560 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEJ1	YLR265C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NEJ1	YLR265C	NPR3	P38742	1146 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEJ1	YLR265C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NEJ1	YLR265C	YIR014W	P40570	242 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEJ1	YLR265C	IAH1	P41734	238 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEJ1	YLR265C	FET5	P43561	622 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEJ1	YLR265C	RSM28	Q03430	361 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEJ1	YLR265C	DAP1	Q12091	152 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEJ1	YLR265C	COX17	Q12287	69 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEJ1	YLR265C	PCD1	Q12524	340 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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