RNA–Protein interactions for RNA: YOL092W

YPQ1, Transcript of Putative vacuolar membrane transporter for cationic amino acids, yeastyeast

Gene YPQ1, Length 927 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1YOL092W PMI40P29952 429 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data7.25□□□□□ -1.25not detected
YPQ1YOL092W ECM2P38241 364 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W RRP3P38712 501 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W LRP1P38801 184 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W LTP1P40347 161 aa7.25□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W RGD2P43556 714 aa7.25□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W COG1P53079 417 aa7.25□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W CWC22P53333 577 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W SUN4P53616 420 aa7.25□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W SIW14P53965 281 aa7.25□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W SLU7Q02775 382 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W YMR160WQ03823 816 aa7.25□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W TDA9Q04545 1251 aa7.25□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W AIM41Q12032 185 aa7.25□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W MCM16Q12262 181 aa7.25□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W YLR149CQ99296 730 aa7.25□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W POL2P21951 2222 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W CDC24P11433 854 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W TRM1P15565 570 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W AEP1P32493 518 aa7.24□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W GCD6P32501 712 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W PHO11P35842 467 aa7.24□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W MSG5P38590 489 aa7.24□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W PHO12P38693 467 aa7.24□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W MSR1P38714 643 aa7.24□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W YIL108WP40483 696 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W SUM1P46676 1062 aa7.24□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W HLJ1P48353 224 aa7.24□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W SAP4P53036 818 aa7.24□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W SWS2P53937 143 aa7.24□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W RSC4Q02206 625 aa7.24□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W NUP100Q02629 959 aa7.24□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W TRM82Q03774 444 aa7.24□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W YDR132CQ03900 495 aa7.24□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W SML1Q04964 104 aa7.24□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W RTT10Q08924 1013 aa7.24□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W LDB17Q12342 491 aa7.24□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W ZRT2Q12436 422 aa7.24□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W AVL9Q12500 764 aa7.24□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W YOR338WQ99326 363 aa7.24□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W GAL11P19659 1081 aa7.23□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W YKL151CP36059 337 aa7.23□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W YBR259WP38338 688 aa7.23□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W OCA5P38738 679 aa7.23□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W SMF1P38925 575 aa7.23□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W FAA3P39002 694 aa7.23□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W RPL34BP40525 121 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W DSN1P40568 576 aa7.23□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W CIS3P47001 227 aa7.23□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W IML2P47031 731 aa7.23□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W SWC4P53201 476 aa7.23□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W YAT1P80235 687 aa7.23□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W RLI1Q03195 608 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W YDR444WQ04093 687 aa7.23□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W ECI1Q05871 280 aa7.23□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W EAF1Q06337 982 aa7.23□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W CUP1-1P0CX80 61 aa7.22□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W CUP1-2P0CX81 61 aa7.22□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W UBA1P22515 1024 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W ERG6P25087 383 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W SLD2P34252 453 aa7.22□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W TIM17P39515 158 aa7.22□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W RGI2P40188 164 aa7.22□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W CTK3P46963 296 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W ATG36P46983 293 aa7.22□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W RPC17P47076 161 aa7.22□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W FRE4P53746 719 aa7.22□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W YNL143CP53908 130 aa7.22□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W URH1Q04179 340 aa7.22□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W ESC2Q06340 456 aa7.22□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W TFB4Q12004 338 aa7.22□□□□□ -1.25
YPQ1YOL092W RAS1P01119 309 aa7.21□□□□□ -1.26
YPQ1YOL092W TUB1P09733 447 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
YPQ1YOL092W YKR104WP0CE69 306 aa7.21□□□□□ -1.26
YPQ1YOL092W ERR1P0CX10 437 aa7.21□□□□□ -1.26
YPQ1YOL092W ERR2P0CX11 437 aa7.21□□□□□ -1.26
YPQ1YOL092W RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
YPQ1YOL092W RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
YPQ1YOL092W POL30P15873 258 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
YPQ1YOL092W YSP3P25036 478 aa7.21□□□□□ -1.26
YPQ1YOL092W TSR4P25040 408 aa7.21□□□□□ -1.26
YPQ1YOL092W GID7P25569 745 aa7.21□□□□□ -1.26
YPQ1YOL092W MRPL9P31334 269 aa7.21□□□□□ -1.26
YPQ1YOL092W KES1P35844 434 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
YPQ1YOL092W MMS21P38632 267 aa7.21□□□□□ -1.26
YPQ1YOL092W SRP72P38688 640 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
YPQ1YOL092W SMF2P38778 549 aa7.21□□□□□ -1.26
YPQ1YOL092W ERR3P42222 437 aa7.21□□□□□ -1.26
YPQ1YOL092W TAH11P47112 604 aa7.21□□□□□ -1.26
YPQ1YOL092W PCL10P53124 433 aa7.21□□□□□ -1.26
YPQ1YOL092W YPR003CP53394 754 aa7.21□□□□□ -1.26
YPQ1YOL092W MET14Q02196 202 aa7.21□□□□□ -1.26
YPQ1YOL092W POB3Q04636 552 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
YPQ1YOL092W GSF2Q04697 403 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
YPQ1YOL092W RPN8Q08723 338 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
YPQ1YOL092W SRO7Q12038 1033 aa7.21□□□□□ -1.26
YPQ1YOL092W RKM5Q12367 367 aa7.21□□□□□ -1.26
YPQ1YOL092W QCR6P00127 147 aa7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.9 ms