RNA–Protein interactions for RNA: YMR053C

STB2, Transcript of Protein that interacts with Sin3p in a two-hybrid assay, yeast

Gene STB2, Length 2,553 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STB2	YMR053C	GSH2	Q08220	491 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	CTF3	Q12748	733 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	RPC31	P17890	251 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YPK2	P18961	677 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	MRPL36	P36531	177 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	MRPL37	P36532	105 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	MET28	P40573	187 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	MAD2	P40958	196 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	HNT2	P49775	206 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YLR297W	Q05899	129 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YLR173W	Q06247	608 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	AFI1	Q99222	893 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	PEP3	P27801	918 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	AFG1	P32317	509 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	MRP20	P32387	263 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	CST26	P38226	397 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	COQ6	P53318	479 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YDR514C	Q04408	483 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	SOV1	Q04748	898 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YIG1	Q08956	461 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	GPA1	P08539	472 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	SNT1	P25357	1226 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	ALG14	P38242	237 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	BEM4	P39011	633 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	IMA1	P53051	589 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	MNT2	P53059	558 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	MEC3	Q02574	474 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YMR102C	Q03177	834 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	ATC1	Q04005	294 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	ECM11	Q04110	302 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YLR455W	Q06188	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	VAC14	Q06708	880 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	ENT4	Q07872	247 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	GNT1	Q12096	491 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	SCC4	P40090	624 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	RGI2	P40188	164 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YGL138C	P53122	345 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	MUK1	Q02866	612 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	PUS5	Q06244	254 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	RIM20	Q12033	661 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	DIN7	Q12086	430 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	NBP2	Q12163	236 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	HXT1	P32465	570 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	OCT1	P35999	772 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	SHU2	P38957	223 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	PRM9	P39551	298 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YER085C	P40058	173 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YTA12	P40341	825 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	VID28	P40547	921 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	ELP2	P42935	788 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	URB2	P47108	1174 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	RMR1	P53060	241 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YGR111W	P53265	400 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YNL143C	P53908	130 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	CSI1	Q04368	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	UAF30	Q08747	228 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	WTM2	Q12206	467 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	HOS1	Q12214	470 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	AFG2	P32794	780 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	YHR182W	P38870	785 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	REV7	P38927	245 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	PNT1	P38969	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	SSO2	P39926	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	OTU1	P43558	301 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STB2	YMR053C	AQR1	P53943	586 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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