RNA–Protein interactions for RNA: YHR160C

PEX18, Transcript of Peroxin, yeast

Gene PEX18, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX18	YHR160C	HAP1	P0CE41	1502 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	SWD1	P39706	426 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	SAW1	P39735	261 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	UBP7	P40453	1071 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	AAT1	Q01802	451 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	ARA2	Q04212	335 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	MRPL1	Q04599	285 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	GSH1	P32477	678 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	SDS22	P36047	338 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	RAD26	P40352	1085 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	STB2	P46679	850 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	ASK10	P48361	1146 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	YAT1	P80235	687 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	TAF5	P38129	798 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	ERC1	P38767	581 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	VPS64	Q03944	604 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	CRD1	Q07560	283 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	AIM6	Q07716	390 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	AAD4	Q07747	329 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	ICL2	Q12031	575 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.87	□□□□□ -1.79	not detected
PEX18	YHR160C	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	MRC1	P25588	1096 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	YLF2	P38746	405 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	YPL191C	Q08930	360 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	SSM4	P40318	1319 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	SIP1	P32578	815 aa		3.85	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	YIR016W	P40572	265 aa		3.85	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	NPA3	P47122	385 aa		3.85	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	TGL2	P54857	326 aa		3.85	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	SNA4	Q07549	140 aa		3.85	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		3.85	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	TY4B-J	P47024	1803 aa		3.85	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	PTC6	P25646	442 aa		3.84	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	ATO2	P32907	282 aa		3.84	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	MDV1	P47025	714 aa		3.84	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	MAD3	P47074	515 aa		3.84	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	YPR003C	P53394	754 aa		3.84	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	ATX2	Q12067	313 aa		3.84	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	RRI1	Q12468	440 aa		3.84	□□□□□ -1.79
PEX18	YHR160C	COX1	P00401	534 aa		3.83	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	CNA1	P23287	553 aa		3.83	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	SCO2	P38072	301 aa		3.83	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	YJL107C	P42947	387 aa		3.83	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	ORC5	P50874	479 aa		3.83	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	ARP7	Q12406	477 aa		3.83	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	MPD2	Q99316	277 aa		3.83	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	YRF1-2	P40105	1681 aa		3.82	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	PDR11	P40550	1411 aa		3.82	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	PDE1	P22434	369 aa		3.82	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	NUP53	Q03790	475 aa		3.82	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	SND1	Q04007	877 aa		3.82	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	SRL1	Q08673	210 aa		3.82	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		3.82	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	ARN1	P38731	627 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	YPT11	P48559	417 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	YGR079W	P53249	370 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	THI3	Q07471	609 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	BUD7	Q08754	746 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	LAC1	P28496	418 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	GCS1	P35197	352 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	YAP3	P38749	330 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	YIL152W	P40455	235 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	CDC1	P40986	491 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	BOP3	P53958	396 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	VTC3	Q02725	835 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	YOL114C	Q12322	202 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	YIL177C	P40434	1758 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	YJL225C	P40889	1758 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	YCR043C	P25361	127 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	MSS51	P32335	436 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	NIC96	P34077	839 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	YNL144C	P53907	740 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	UBX3	Q12229	455 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8

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