RNA–Protein interactions for RNA: YER063W

THO1, Transcript of Conserved nuclear RNA-binding protein, yeast

Gene THO1, Length 657 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
THO1	YER063W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	POL3	P15436	1097 aa		3.58	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	COQ3	P27680	312 aa		3.58	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	SLC1	P33333	303 aa		3.58	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	PXA2	P34230	853 aa		3.58	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	APM3	P38153	483 aa		3.58	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	ERC1	P38767	581 aa		3.58	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	ESL1	P40456	1118 aa		3.58	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	SGM1	P47166	707 aa		3.58	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	MPS1	P54199	764 aa		3.58	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	MRPL13	Q02204	264 aa		3.58	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	ATG21	Q02887	496 aa		3.58	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	ARA2	Q04212	335 aa		3.58	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	HIM1	Q06674	414 aa		3.58	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	HIF1	Q12373	385 aa		3.58	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	RIT1	P23796	513 aa		3.57	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	UME6	P39001	836 aa		3.57	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	YIL024C	P40543	189 aa		3.57	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	NPA3	P47122	385 aa		3.57	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	MEP3	P53390	489 aa		3.57	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	RCF1	Q03713	159 aa		3.57	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	YLR352W	Q06479	807 aa		3.57	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	GEP3	Q08622	556 aa		3.57	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	PGS1	P25578	521 aa		3.56	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	PTC6	P25646	442 aa		3.56	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	GSH1	P32477	678 aa		3.56	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	NUP120	P35729	1037 aa		3.56	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	ERV46	P39727	415 aa		3.56	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	PCI8	P40512	444 aa		3.56	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	CFD1	P40558	293 aa		3.56	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	ERR3	P42222	437 aa		3.56	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	GRC3	Q07845	632 aa		3.56	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	SDH5	Q08230	162 aa		3.56	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	SCM3	Q12334	223 aa		3.56	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	YPR089W	O13585	888 aa		3.55	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	COX1	P00401	534 aa		3.55	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	NUC1	P08466	329 aa		3.55	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.55	□□□□□ -1.84	not detected
THO1	YER063W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	LAC1	P28496	418 aa		3.55	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	NPR3	P38742	1146 aa		3.55	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	SPC97	P38863	823 aa		3.55	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	SKP2	P42843	763 aa		3.55	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	UBX6	P47049	396 aa		3.55	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	YGR079W	P53249	370 aa		3.55	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	TAH18	Q12181	623 aa		3.55	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	PET122	P10355	254 aa		3.54	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	MTF2	P10849	440 aa		3.54	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	YCL049C	P25577	312 aa		3.54	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	RAD16	P31244	790 aa		3.54	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	PAH1	P32567	862 aa		3.54	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	ASK1	P35734	292 aa		3.54	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	HES1	P35843	434 aa		3.54	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	FLO5	P38894	1075 aa		3.54	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	SPC72	P39723	622 aa		3.54	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	ORC5	P50874	479 aa		3.54	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	IMA1	P53051	589 aa		3.54	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	FCP1	Q03254	732 aa		3.54	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	CIA1	Q05583	330 aa		3.54	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	YLR287C	Q05881	355 aa		3.54	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	THI3	Q07471	609 aa		3.54	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	HER1	Q12276	1246 aa		3.54	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	SUL2	Q12325	893 aa		3.54	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		3.54	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	SEM1	O94742	89 aa		3.53	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	URK1	P27515	501 aa		3.53	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	MSS51	P32335	436 aa		3.53	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	PSF2	P40359	213 aa		3.53	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	UBP7	P40453	1071 aa		3.53	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	TAM41	P53230	385 aa		3.53	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	YPL068C	Q02749	293 aa		3.53	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	YDR109C	Q04585	715 aa		3.53	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	MRPL1	Q04599	285 aa		3.53	□□□□□ -1.84
THO1	YER063W	GTB1	Q04924	702 aa		3.53	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11 ms