RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	SML1	Q04964	104 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	ASM4	Q05166	528 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	GPR1	Q12361	961 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	PCD1	Q12524	340 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	MOT1	P32333	1867 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	DIF1	O13577	133 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	CSG2	P35206	410 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	JNM1	P36224	373 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	RCK2	P38623	610 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	TDA3	P38758	523 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	RTT107	P38850	1070 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	IES1	P43579	692 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	YJR054W	P47114	497 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	AZR1	P50080	613 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	ZIP2	P53061	704 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	ATG16	Q03818	150 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	APL4	Q12028	832 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	TGL5	Q12043	749 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	PMS1	P14242	873 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	TUP1	P16649	713 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	CDC42	P19073	191 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	RAD57	P25301	460 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	BCS1	P32839	456 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	UIP5	P36137	443 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	MRPL7	P36519	292 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	ESL1	P40456	1118 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	CPR7	P47103	393 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	KAP114	P53067	1004 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	YGR111W	P53265	400 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	NGL3	Q03210	505 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	PPM1	Q04081	328 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	IRC13	Q08630	104 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	PET123	P17558	318 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	PCH2	P38126	564 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	YHL026C	P38740	315 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	ERC1	P38767	581 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	PHO86	P46956	311 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	ALY2	P47029	1046 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	RPC17	P47076	161 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	SCS3	P53012	380 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	BOP3	P53958	396 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	SOV1	Q04748	898 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	SHS1	Q07657	551 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	SFI1	Q12369	946 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CPR4	YCR069W	CDC8	P00572	216 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	POL3	P15436	1097 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	VPS3	P23643	1011 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	DBF4	P32325	704 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	YKL050C	P35736	922 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	YBR259W	P38338	688 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	HIS2	P38635	335 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	PCL5	P38794	229 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	GDH3	P39708	457 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	AFG3	P39925	761 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	YER186C	P40101	306 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	OSW7	P43611	510 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	MND1	P53102	219 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	TAF10	Q12030	206 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	NUR1	Q12066	484 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	SLX4	Q12098	748 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	ECM3	Q99252	613 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	JIP3	O13555	125 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.4 ms