RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000167111.5

Rabggtb-202, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabggtb, Length 1,418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 H2al1aQ5M8Q2 105 aa4.63□□□□□ -1.67
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 H2al1eQ810S6 105 aa4.63□□□□□ -1.67
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Uqcr11Q9CPX8 56 aa4.63□□□□□ -1.67
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Phxr4P15974 95 aa4.6□□□□□ -1.67
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Serp1Q9Z1W5 66 aa4.6□□□□□ -1.67
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm10337F7DEP7 55 aa4.55□□□□□ -1.68
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm10153A0A1B0GRL1 320 aa4.53□□□□□ -1.68
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rps28P62858 69 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Macf1Q9QXZ0 7354 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 H2al1bA0A087WP11 105 aa4.52□□□□□ -1.69
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ndufb1P0DN34 57 aa4.52□□□□□ -1.69
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Brk1Q91VR8 75 aa4.51□□□□□ -1.69
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gpr98Q8VHN7 6298 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm17402F6Z0L5 76 aa4.47□□□□□ -1.69
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm9955Q8CEJ8 102 aa4.47□□□□□ -1.69
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Kmt2dQ6PDK2 5588 aa4.46□□□□□ -1.7
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 H2al1kJ3QP08 105 aa4.46□□□□□ -1.7
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 H2al1mQ9DAD9 105 aa4.46□□□□□ -1.7
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mt3P28184 68 aa4.42□□□□□ -1.7
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Krtap5-2Q9D5Z7 189 aa4.41□□□□□ -1.7
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sprr2a3Q4KL71 83 aa4.4□□□□□ -1.7
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sprr2a1Q9CQK8 83 aa4.4□□□□□ -1.7
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm10272F7CZ33 110 aa4.38□□□□□ -1.71
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Muc19Q6PZE0 7524 aa4.34□□□□□ -1.72
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sprr2iO70560 76 aa4.29□□□□□ -1.72
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm4553A0A1B0GSA9 284 aa4.28□□□□□ -1.72
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Krtap5-4Q62220 223 aa4.26□□□□□ -1.73
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm45337A0A1B0GS71 263 aa4.18□□□□□ -1.74
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm11568A2A4M2 211 aa4.17□□□□□ -1.74
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Krtap9-1Q64526 186 aa4.17□□□□□ -1.74
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 4933415A04RikQ9D443 101 aa4.13□□□□□ -1.75
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm20538F6Z9R1 75 aa4.09□□□□□ -1.75
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Hmcn1D3YXG0 5634 aa4.07□□□□□ -1.76
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm3880A0A1B0GSB3 72 aa4.06□□□□□ -1.76
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Syne1Q6ZWR6 8799 aa4.05□□□□□ -1.76
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Camk2n1Q6QWF9 78 aa4.04□□□□□ -1.76
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Krtap19-9bQ99NG9 58 aa4.04□□□□□ -1.76
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ndufs5Q99LY9 106 aa4.02□□□□□ -1.77
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 DstQ91ZU6 7393 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 NebE9Q1W3 7152 aa4□□□□□ -1.77
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Lce3bQ9CQM7 98 aa3.96□□□□□ -1.77
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm12216A0A1W2P827 62 aa3.95□□□□□ -1.78
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm3646F6S692 53 aa3.94□□□□□ -1.78
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mp68P56379 58 aa3.92□□□□□ -1.78
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Krtap4-16Q91W93 202 aa3.9□□□□□ -1.78
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Romo1P60603 79 aa3.89□□□□□ -1.79
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm40460A0A1B0GR10 244 aa3.86□□□□□ -1.79
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm7579A0A1B0GRJ4 243 aa3.86□□□□□ -1.79
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Krtap5-5Q2TA51 241 aa3.86□□□□□ -1.79
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Krtap19-4Q925H7 84 aa3.85□□□□□ -1.79
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 AhnakE9Q616 5656 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sprr2fO70557 76 aa3.72□□□□□ -1.81
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm11938Q9D3H4 131 aa3.67□□□□□ -1.82
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Krtap7-1Q9D3I6 87 aa3.67□□□□□ -1.82
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mt1P02802 61 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm40193A0A1B0GT39 78 aa3.61□□□□□ -1.83
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tnp1P10856 55 aa3.58□□□□□ -1.84
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Krtap5-1Q64507 230 aa3.47□□□□□ -1.85
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm9112A2AI92 75 aa3.44□□□□□ -1.86
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Lce3cQ91V05 98 aa3.42□□□□□ -1.86
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ndufaf8A2AMZ4 74 aa3.36□□□□□ -1.87
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Lce3dE9Q8V1 98 aa3.35□□□□□ -1.87
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm4559A4IF42 199 aa3.29□□□□□ -1.88
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 ObscnA2AAJ9 8891 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Lce3eF8VQJ0 98 aa3.17□□□□□ -1.9
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Lce3fQ6PAI4 98 aa3.17□□□□□ -1.9
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sprr2dO70555 85 aa3.1□□□□□ -1.91
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 4933428G20RikQ9D3X4 101 aa3.06□□□□□ -1.92
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sprr2eO70556 76 aa3.03□□□□□ -1.92
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Lce3aQ497I5 98 aa3.03□□□□□ -1.92
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sprr2hO70559 108 aa2.99□□□□□ -1.93
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Muc16A0A140LJ72 8478 aa2.88□□□□□ -1.95
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm10024A0A0A0MQA4 119 aa2.86□□□□□ -1.95
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Krtap6-5Q925H3 78 aa2.68□□□□□ -1.98
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm10229O08631 77 aa2.56□□□□□ -2
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1110025L11RikO09048 78 aa2.51□□□□□ -2.01
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sprr2bO70554 98 aa2.31□□□□□ -2.04
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Krtap6-2O08884 159 aa2.22□□□□□ -2.05
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Krtap21-1Q925H4 128 aa2□□□□□ -2.09
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Phgr1Q8K0G7 91 aa1.66□□□□□ -2.14
Retrieved 80 of 22,080 RNA–protein pairs in 918 ms