Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
NebE9Q1W3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NebE9Q1W3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NebE9Q1W3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
NebE9Q1W3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NebE9Q1W3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NebE9Q1W3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NebE9Q1W3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NebE9Q1W3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
NebE9Q1W3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
NebE9Q1W3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
NebE9Q1W3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NebE9Q1W3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NebE9Q1W3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
NebE9Q1W3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
NebE9Q1W3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NebE9Q1W3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
NebE9Q1W3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NebE9Q1W3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
NebE9Q1W3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
NebE9Q1W3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
NebE9Q1W3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NebE9Q1W3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NebE9Q1W3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NebE9Q1W3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NebE9Q1W3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NebE9Q1W3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NebE9Q1W3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NebE9Q1W3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NebE9Q1W3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NebE9Q1W3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NebE9Q1W3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NebE9Q1W3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NebE9Q1W3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NebE9Q1W3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NebE9Q1W3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NebE9Q1W3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NebE9Q1W3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NebE9Q1W3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NebE9Q1W3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NebE9Q1W3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NebE9Q1W3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
NebE9Q1W3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NebE9Q1W3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NebE9Q1W3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NebE9Q1W3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NebE9Q1W3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
NebE9Q1W3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
NebE9Q1W3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
NebE9Q1W3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NebE9Q1W3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
NebE9Q1W3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NebE9Q1W3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NebE9Q1W3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NebE9Q1W3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NebE9Q1W3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NebE9Q1W3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
NebE9Q1W3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
NebE9Q1W3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NebE9Q1W3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
NebE9Q1W3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NebE9Q1W3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NebE9Q1W3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
NebE9Q1W3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
NebE9Q1W3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
NebE9Q1W3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NebE9Q1W3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
NebE9Q1W3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NebE9Q1W3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
NebE9Q1W3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NebE9Q1W3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NebE9Q1W3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
NebE9Q1W3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
NebE9Q1W3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NebE9Q1W3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NebE9Q1W3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NebE9Q1W3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NebE9Q1W3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
NebE9Q1W3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
NebE9Q1W3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
NebE9Q1W3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NebE9Q1W3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NebE9Q1W3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
NebE9Q1W3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NebE9Q1W3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NebE9Q1W3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
NebE9Q1W3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
NebE9Q1W3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NebE9Q1W3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NebE9Q1W3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NebE9Q1W3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NebE9Q1W3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NebE9Q1W3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
NebE9Q1W3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
NebE9Q1W3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
NebE9Q1W3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
NebE9Q1W3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
NebE9Q1W3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
NebE9Q1W3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
NebE9Q1W3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
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