RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	SPE1	P08432	466 aa		5.9	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	PCK1	P10963	549 aa		5.9	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	DAL3	P32459	195 aa		5.9	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.9	□□□□□ -1.46	not detected
PSH1	YOL054W	BIT2	P38346	545 aa		5.9	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	YHL049C	P38722	271 aa		5.9	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	YEL075C	P39972	122 aa		5.9	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	YER189W	P40104	122 aa		5.9	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	YFL064C	P43540	174 aa		5.9	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	NMD5	P46970	1048 aa		5.9	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	URB2	P47108	1174 aa		5.9	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	RIM8	P53179	542 aa		5.9	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	TGL2	P54857	326 aa		5.9	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	TDA9	Q04545	1251 aa		5.9	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		5.9	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	YLR149C	Q99296	730 aa		5.9	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		5.9	□□□□□ -1.46
PSH1	YOL054W	JIP3	O13555	125 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	5.89	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	NIC96	P34077	839 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	SUL1	P38359	859 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	PIH1	P38768	344 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	SPC72	P39723	622 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	INA22	P40576	216 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	MND2	P40577	368 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	PCL10	P53124	433 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	SLD3	P53135	668 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	JJJ1	P53863	590 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	PGA2	P53903	129 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	KIN4	Q01919	800 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	SKY1	Q03656	742 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	TAF9	Q05027	157 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	CUR1	Q06469	252 aa		5.89	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	SWI6	P09959	803 aa		5.88	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	YKU70	P32807	602 aa		5.88	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	YKL050C	P35736	922 aa		5.88	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	RPC37	P36121	282 aa		5.88	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	TDA10	P42938	290 aa		5.88	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	MDR1	P53258	950 aa		5.88	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	GTR1	Q00582	310 aa		5.88	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	MET14	Q02196	202 aa		5.88	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	FAR8	Q05040	523 aa		5.88	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	YLR177W	Q06251	628 aa		5.88	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	GRX6	Q12438	231 aa		5.88	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	GAL10	P04397	699 aa		5.87	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	RAD3	P06839	778 aa		5.87	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	HSP78	P33416	811 aa		5.87	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	YBR062C	P38239	180 aa		5.87	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	HIS2	P38635	335 aa		5.87	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	RIM4	P38741	713 aa		5.87	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	GSM1	P42950	618 aa		5.87	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	SSY5	P47002	699 aa		5.87	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	BRO1	P48582	844 aa		5.87	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	SHR3	Q02774	210 aa		5.87	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	ATG16	Q03818	150 aa		5.87	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	PEX15	Q08215	383 aa		5.87	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	MED7	Q08278	222 aa		5.87	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	POL3	P15436	1097 aa		5.86	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	MRPS28	P21771	286 aa		5.86	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	YKL222C	P35995	705 aa		5.86	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	FUI1	P38196	639 aa		5.86	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	CST26	P38226	397 aa		5.86	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	RRT2	P38332	387 aa		5.86	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	YHR078W	P38799	552 aa		5.86	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	HXT7	P39004	570 aa		5.86	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	END3	P39013	349 aa		5.86	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	LCB2	P40970	561 aa		5.86	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	ORC4	P54791	529 aa		5.86	□□□□□ -1.47

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