RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	DDC1	Q08949	612 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	HOS1	Q12214	470 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	GPM3	Q12326	303 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	ECM29	P38737	1868 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	GAL80	P04387	435 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	YMR085W	P0CF18	432 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.68	□□□□□ -1.34	RIP-Chip
MIA40	YKL195W	YBR053C	P38235	358 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	TVP23	P38962	199 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	YJL206C	P39529	758 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	ESL1	P40456	1118 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	RRT5	P43607	289 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	IML2	P47031	731 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	SKP1	P52286	194 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	NNF2	P53253	936 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	VPS9	P54787	451 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	AAD15	Q08361	143 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	NRT1	Q08485	598 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	GPM2	Q12008	311 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	YDR215C	Q12240	137 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	YPT6	Q99260	215 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.67	□□□□□ -1.34	not detected
MIA40	YKL195W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	RPB10	P22139	70 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	TKL2	P33315	681 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	SLA2	P33338	968 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	STE13	P33894	931 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	FZO1	P38297	855 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	ERP5	P38819	212 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	AFG3	P39925	761 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	CDC1	P40986	491 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	FAR3	P46671	204 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	ILM1	P47155	203 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	NCS6	P53088	359 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	YPR003C	P53394	754 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	SPC98	P53540	846 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	TEP1	P53916	434 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	KTR6	P54070	446 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	SLG1	P54867	378 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	ADY3	Q07732	790 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	NBP2	Q12163	236 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	ARP7	Q12406	477 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	SPE4	Q12455	300 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	TPK1	P06244	397 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	RAD3	P06839	778 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	ERR1	P0CX10	437 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	ERR2	P0CX11	437 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	TSR4	P25040	408 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	GID7	P25569	745 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	YCL068C	P25593	260 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	RAD55	P38953	406 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	PRM9	P39551	298 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	ERR3	P42222	437 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	YNL011C	P53980	444 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	TFB2	Q02939	513 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	HEH2	Q03281	663 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	YMR160W	Q03823	816 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	GTB1	Q04924	702 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	LDB17	Q12342	491 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	MOT1	P32333	1867 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	HAP2	P06774	265 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	NDI1	P32340	513 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	RRN3	P36070	627 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	MRPL7	P36519	292 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	YAT2	P40017	923 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	PEP8	P40335	379 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	PRK1	P40494	810 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	TAF1	P46677	1066 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	GUF1	P46943	645 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	YJL132W	P47014	750 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	YNR040W	P53736	256 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	SLT2	Q00772	484 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MIA40	YKL195W	ULP1	Q02724	621 aa		6.65	□□□□□ -1.34

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 80.2 ms