RNA–Protein interactions for RNA: YJL059W

YHC3, Transcript of Protein required for the ATP-dependent transport of arginine, yeastyeast

Gene YHC3, Length 1,227 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC3YJL059W LRS4Q04087 347 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W PCL8Q08966 492 aa7.07□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W RPS9BP05755 195 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W SUI3P09064 285 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W PCK1P10963 549 aa7.06□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W PHO84P25297 587 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W YCL002CP25565 263 aa7.06□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W YEL043WP32618 956 aa7.06□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W DAD2P36162 133 aa7.06□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W CTM1P38818 585 aa7.06□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W FLC2P39719 783 aa7.06□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W RPN3P40016 523 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W SEC9P40357 651 aa7.06□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W EPL1P43572 832 aa7.06□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W YJR039WP47107 1121 aa7.06□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W NCS6P53088 359 aa7.06□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W DSD1P53095 428 aa7.06□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W NAM8Q00539 523 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W YSA1Q01976 231 aa7.06□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W RSA3Q05942 220 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W YPR196WQ06595 470 aa7.06□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W ADE6P38972 1358 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W GCD1P09032 578 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W CDC26P14724 124 aa7.05□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W RIT1P23796 513 aa7.05□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W KNS1P32350 737 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W SUR1P33300 382 aa7.05□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W YKL151CP36059 337 aa7.05□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W SET5P38890 526 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W GIP2P40036 548 aa7.05□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W JJJ3P47138 172 aa7.05□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W ORC4P54791 529 aa7.05□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W YAP6Q03935 383 aa7.05□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W RBA50Q04418 439 aa7.05□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W VBA4Q04602 768 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W TRI1Q05024 226 aa7.05□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W SKG3Q06315 1026 aa7.05□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data7.05□□□□□ -1.28not detected
YHC3YJL059W RIX7Q07844 837 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W ALG6Q12001 544 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W SPE3Q12074 293 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W NMD4Q12129 218 aa7.05□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W YLL058WQ12198 575 aa7.05□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W COX17Q12287 69 aa7.05□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W GRX6Q12438 231 aa7.05□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W RPS9AO13516 197 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W CBS1P14066 229 aa7.04□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W APE1P14904 514 aa7.04□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W RPB4P20433 221 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W MRPL25P23369 157 aa7.04□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W SWI4P25302 1093 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W SMY1P32364 656 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W SLA2P33338 968 aa7.04□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W COY1P34237 679 aa7.04□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W FSH1P38777 243 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W LYS9P38999 446 aa7.04□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W EFM4P40516 257 aa7.04□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W GTB1Q04924 702 aa7.04□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W SLP1Q12232 587 aa7.04□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W PSY3Q12318 242 aa7.04□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W GPM3Q12326 303 aa7.04□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W Q0142Q9ZZW4 58 aa7.04□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W YLR358CO13565 187 aa7.03□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W RPS17AP02407 136 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W ADE3P07245 946 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W RPS17BP14127 136 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W MRP4P32902 394 aa7.03□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W YUH1P35127 236 aa7.03□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W SSZ1P38788 538 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W NAS2P40555 220 aa7.03□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W IMA1P53051 589 aa7.03□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W RPN14P53196 417 aa7.03□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W DAK1P54838 584 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W YMR210WQ03649 449 aa7.03□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W RIM20Q12033 661 aa7.03□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W HER1Q12276 1246 aa7.03□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W YDR461C-AQ2V2P7 80 aa7.03□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W YOL159C-AQ3E769 90 aa7.03□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W RAV1P47104 1357 aa7.03□□□□□ -1.28
YHC3YJL059W PRC1P00729 532 aa7.02□□□□□ -1.29
YHC3YJL059W TUB2P02557 457 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
YHC3YJL059W YCK1P23291 538 aa7.02□□□□□ -1.29
YHC3YJL059W YCR051WP25631 222 aa7.02□□□□□ -1.29
YHC3YJL059W IMG2P25642 146 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
YHC3YJL059W ARC19P33204 171 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
YHC3YJL059W UBP11P36026 717 aa7.02□□□□□ -1.29
YHC3YJL059W RPC37P36121 282 aa7.02□□□□□ -1.29
YHC3YJL059W PCH2P38126 564 aa7.02□□□□□ -1.29
YHC3YJL059W COS111P38308 924 aa7.02□□□□□ -1.29
YHC3YJL059W YHR054CP38780 354 aa7.02□□□□□ -1.29
YHC3YJL059W YHR097CP38809 366 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
YHC3YJL059W SMF1P38925 575 aa7.02□□□□□ -1.29
YHC3YJL059W PFK26P40433 827 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
YHC3YJL059W YIL089WP40500 205 aa7.02□□□□□ -1.29
YHC3YJL059W IST3P40565 148 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.4 ms