RNA–Protein interactions for RNA: YHR208W

BAT1, Transcript of Mitochondrial branched-chain amino acid (BCAA) aminotransferase, yeast

Gene BAT1, Length 1,182 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BAT1	YHR208W	HSP32	Q08992	237 aa		3.01	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	TRM8	Q12009	286 aa		3.01	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	SUT2	Q12286	268 aa		3.01	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	TAF3	Q12297	353 aa		3.01	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		3.01	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	RPN13	O13563	156 aa		3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	ARG3	P05150	338 aa		3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	CDC26	P14724	124 aa		3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	CLB3	P24870	427 aa		3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	CWH43	P25618	953 aa		3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	PET127	P32606	800 aa		3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	PEX2	P32800	271 aa		3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	GMH1	P36125	273 aa		3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	IFA38	P38286	347 aa		3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	PES4	P39684	611 aa		3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	IMA5	P40884	581 aa		3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	YJL055W	P47044	245 aa		3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	IMA1	P53051	589 aa		3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	YGR151C	P53287	111 aa		3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	JJJ1	P53863	590 aa		3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	VTI1	Q04338	217 aa		3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	YDR286C	Q05530	114 aa		3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	THI22	Q06490	572 aa		3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	RTN2	Q12443	393 aa		3	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	CTT1	P06115	562 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	RIT1	P23796	513 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	MNE1	P24720	663 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	ROX1	P25042	368 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	KIN82	P25341	720 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	ERG3	P32353	365 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	SWH1	P35845	1188 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	YHR033W	P38690	423 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	FLC2	P39719	783 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	SSU1	P41930	458 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	SKP2	P42843	763 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	TAF4	P50105	388 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	MNT2	P53059	558 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	PEF1	P53238	335 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	SPC98	P53540	846 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	EOS1	P53938	366 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	ZDS2	P54786	942 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	SEC5	P89102	971 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	PEX25	Q02969	394 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	VPS64	Q03944	604 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	RCO1	Q04779	684 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	CTI6	Q08923	506 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	NUS1	Q12063	375 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	POM34	Q12445	299 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	MET17	P06106	444 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	SEC12	P11655	471 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	STE50	P25344	346 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	FUB1	P25659	250 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	NTH1	P32356	751 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	PUP2	P32379	260 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	SET3	P36124	751 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	COS111	P38308	924 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	FTH1	P38310	465 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	NPR2	P39923	615 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	YEL020C	P39994	560 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	YIL077C	P40508	320 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	MAD2	P40958	196 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	PXA1	P41909	870 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	BST1	P43571	1029 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.98	□□□□□ -1.93	not detected
BAT1	YHR208W	SAE2	P46946	345 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	BIT61	P47041	543 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	MPS3	P47069	682 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	YNR071C	P53757	342 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BAT1	YHR208W	VPS75	P53853	264 aa		2.98	□□□□□ -1.93

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