RNA–Protein interactions for RNA: YGR167W

CLC1, Transcript of Clathrin light chain, yeast

Gene CLC1, Length 702 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLC1	YGR167W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	ERR3	P42222	437 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	CIR1	P42940	261 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	NPA3	P47122	385 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	AAT1	Q01802	451 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	ORM2	Q06144	216 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	URK1	P27515	501 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	SWC3	P31376	625 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	PTH2	P34222	208 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	YGR079W	P53249	370 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	IRC3	Q06683	689 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLC1	YGR167W	COX1	P00401	534 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	RPN12	P32496	274 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	BEM3	P32873	1128 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	PSF2	P40359	213 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	XBP1	P40489	647 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	SKP2	P42843	763 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	ZAP1	P47043	880 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	STP3	Q05937	343 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	BLS1	Q06071	122 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	RAD34	Q06665	692 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	NUC1	P08466	329 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	MAK32	P23060	363 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	YCL049C	P25577	312 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	BUD16	P39988	312 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	NMD5	P46970	1048 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	YNL058C	P53947	316 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	YAT1	P80235	687 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	TPO3	Q06451	622 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	FTH1	P38310	465 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	VID27	P40157	782 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	GTB1	Q04924	702 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	LAC1	P28496	418 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	SSH4	P32343	579 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	UBX6	P47049	396 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	MDG1	P53885	366 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	PTC6	P25646	442 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	GSH1	P32477	678 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	HES1	P35843	434 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	MRPL36	P36531	177 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	IFA38	P38286	347 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	NPR3	P38742	1146 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	UBP7	P40453	1071 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	SAP185	P40856	1058 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	CIN1	P40987	1014 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	RSC9	Q03124	581 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	PSR2	Q07949	397 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	COX17	Q12287	69 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	MTF2	P10849	440 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	PTP1	P25044	335 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	ERV46	P39727	415 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	LTP1	P40347	161 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	SMK1	P41808	388 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	SNO3	P43544	222 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	IRC7	P43623	340 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	PCD1	Q12524	340 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLC1	YGR167W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLC1	YGR167W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLC1	YGR167W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLC1	YGR167W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLC1	YGR167W	EXO84	P38261	753 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLC1	YGR167W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLC1	YGR167W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLC1	YGR167W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLC1	YGR167W	NUP120	P35729	1037 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLC1	YGR167W	NET1	P47035	1189 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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