RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000189207.1

Gm28254-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm28254, Length 2,166 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Krtap4-2B1AQ85 167 aa5.08□□□□□ -1.6
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Ly6g6cQ9Z1Q4 126 aa5.08□□□□□ -1.6
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gm9918Q8BUR5 174 aa5.07□□□□□ -1.6
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Igkv4-54A0A0G2JES9 117 aa5.06□□□□□ -1.6
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Krtap26-1Q9D7N2 215 aa5.06□□□□□ -1.6
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Igkv4-68A0A0B4J1I7 117 aa5.05□□□□□ -1.6
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gm10490F6VBM2 120 aa5.05□□□□□ -1.6
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Dnah7cA0A087WR13 4024 aa5.04□□□□□ -1.6
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gm17727E9Q4V7 109 aa5.04□□□□□ -1.6
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Sprr1bQ62267 153 aa5.04□□□□□ -1.6
Gm28254-201ENSMUST00000189207 SycnQ8VCK7 134 aa5.02□□□□□ -1.61
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Igkv4-61A0A0G2JH00 117 aa5.02□□□□□ -1.61
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gm9112A2AI92 75 aa5.02□□□□□ -1.61
Gm28254-201ENSMUST00000189207 AW011738F6S7Q2 159 aa5.01□□□□□ -1.61
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Stard9Q80TF6 4561 aa5.01□□□□□ -1.61
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Spag11Q8K4N2 71 aa5□□□□□ -1.61
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Zcchc13Q9D548 170 aa5□□□□□ -1.61
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Igkv4-72A0A0B4J1I4 117 aa4.99□□□□□ -1.61
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gm43218A0A0G2JGT0 114 aa4.99□□□□□ -1.61
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Sprr4Q8CGN8 76 aa4.99□□□□□ -1.61
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Dnah17Q69Z23 4481 aa4.99□□□□□ -1.61
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Krtap15-1Q9QZU5 150 aa4.99□□□□□ -1.61
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Wfdc10Q3V2J9 124 aa4.98□□□□□ -1.61
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Wfdc15aQ8BH89 80 aa4.98□□□□□ -1.61
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Dnah7bL7N1Y0 4068 aa4.98□□□□□ -1.61
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Vps13dB1ART2 4390 aa4.97□□□□□ -1.61
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Igkv8-16A0A0G2JDG9 121 aa4.97□□□□□ -1.61
Gm28254-201ENSMUST00000189207 SacsQ9JLC8 4582 aa4.95□□□□□ -1.62
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Defb40Q70KL2 73 aa4.95□□□□□ -1.62
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Psors1c2Q80ZC9 134 aa4.95□□□□□ -1.62
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Q8K1L6 76 aa4.95□□□□□ -1.62
Gm28254-201ENSMUST00000189207 2310057N15RikQ9D6T8 200 aa4.95□□□□□ -1.62
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gm9513B3GLJ6 99 aa4.94□□□□□ -1.62
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gm10267M0QWD8 85 aa4.94□□□□□ -1.62
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Spink1P09036 80 aa4.94□□□□□ -1.62
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Defb37Q7TMD2 62 aa4.93□□□□□ -1.62
Gm28254-201ENSMUST00000189207 PscaP57096 123 aa4.92□□□□□ -1.62
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Snhg11Q4G0K9 87 aa4.92□□□□□ -1.62
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Birc6O88738 4882 aa4.92□□□□□ -1.62
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gm2310J3QNJ2 377 aa4.91□□□□□ -1.62
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Pkd1O08852 4293 aa4.9□□□□□ -1.63
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Herc2Q4U2R1 4836 aa4.89□□□□□ -1.63
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Krtap14O08640 167 aa4.89□□□□□ -1.63
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Prp2P05143 317 aa4.89□□□□□ -1.63
Gm28254-201ENSMUST00000189207 3110018I06RikQ9CXS0 120 aa4.89□□□□□ -1.63
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Krtap10-4Q08EG8 221 aa4.88□□□□□ -1.63
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gm10772F7AIG4 85 aa4.88□□□□□ -1.63
Gm28254-201ENSMUST00000189207 P84750 121 aa4.87□□□□□ -1.63
Gm28254-201ENSMUST00000189207 PrcdQ00LT2 53 aa4.87□□□□□ -1.63
Gm28254-201ENSMUST00000189207 2010109I03RikQ9CQ11 111 aa4.87□□□□□ -1.63
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Dnah2P0C6F1 4456 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Wfdc12Q9JHY3 85 aa4.84□□□□□ -1.63
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gm2696A0A1W2P709 240 aa4.83□□□□□ -1.64
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gm18596A0A1W2P860 280 aa4.83□□□□□ -1.64
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Camk2n1Q6QWF9 78 aa4.83□□□□□ -1.64
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Dync1h1Q9JHU4 4644 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
Gm28254-201ENSMUST00000189207 PrlhG3UWC3 86 aa4.82□□□□□ -1.64
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Lce1dQ9D731 133 aa4.82□□□□□ -1.64
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Tomm7Q9D173 55 aa4.81□□□□□ -1.64
Gm28254-201ENSMUST00000189207 A730009L09RikA0A1B0GS82 72 aa4.81□□□□□ -1.64
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gm10065F6TJM2 114 aa4.81□□□□□ -1.64
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Tnp2P11378 117 aa4.81□□□□□ -1.64
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Defb38Q7TNV7 63 aa4.81□□□□□ -1.64
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Anapc11Q9CPX9 84 aa4.81□□□□□ -1.64
Gm28254-201ENSMUST00000189207 PcloQ9QYX7 5068 aa4.81□□□□□ -1.64
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Rpl37aP61514 92 aa4.8□□□□□ -1.64
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Dnah1E9Q8T7 4250 aa4.8□□□□□ -1.64
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Abca13Q5SSE9 5034 aa4.8□□□□□ -1.64
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gm5965D3Z724 196 aa4.8□□□□□ -1.64
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gm21798J3QNU5 87 aa4.79□□□□□ -1.64
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Krtap13O88375 197 aa4.79□□□□□ -1.64
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Fat1A0A1L1SQU7 4645 aa4.79□□□□□ -1.64
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Dnah5Q8VHE6 4621 aa4.79□□□□□ -1.64
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Dmac1Q9CQ00 111 aa4.78□□□□□ -1.64
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Dnah9B1AR51 4484 aa4.78□□□□□ -1.64
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Leap2Q91V13 76 aa4.78□□□□□ -1.64
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Kiaa1109A2AAE1 5005 aa4.77□□□□□ -1.65
Gm28254-201ENSMUST00000189207 1700018G05RikA0A1B0GSI2 66 aa4.77□□□□□ -1.65
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gm7257D3YX25 99 aa4.76□□□□□ -1.65
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Kmt2cQ8BRH4 4903 aa4.76□□□□□ -1.65
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Dnah8Q91XQ0 4731 aa4.75□□□□□ -1.65
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gm28230A0A0A0MQ91 144 aa4.74□□□□□ -1.65
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Pkhd1E9PZ36 4059 aa4.73□□□□□ -1.65
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gm3880A0A1B0GSB3 72 aa4.73□□□□□ -1.65
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Herc1E9PZP8 4859 aa4.72□□□□□ -1.65
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Dnah11E9Q7N9 4488 aa4.71□□□□□ -1.65
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Fam168bQ80XQ8 194 aa4.71□□□□□ -1.65
Gm28254-201ENSMUST00000189207 HydinQ80W93 5154 aa4.7□□□□□ -1.66
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Defb42Q8BVB5 75 aa4.7□□□□□ -1.66
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gpha2Q925Q5 128 aa4.7□□□□□ -1.66
Gm28254-201ENSMUST00000189207 2310061N02RikQ9D6S9 174 aa4.7□□□□□ -1.66
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Mycbp2Q7TPH6 4711 aa4.67□□□□□ -1.66
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Nop10Q9CQS2 64 aa4.67□□□□□ -1.66
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Dnhd1D3Z2X2 4750 aa4.65□□□□□ -1.66
Gm28254-201ENSMUST00000189207 CriptO70333 101 aa4.65□□□□□ -1.67
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gm4491E0CX42 125 aa4.64□□□□□ -1.67
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Gm20537G3UYK7 97 aa4.64□□□□□ -1.67
Gm28254-201ENSMUST00000189207 4930507D05RikQ8C9C9 103 aa4.63□□□□□ -1.67
Gm28254-201ENSMUST00000189207 AplnQ9R0R4 77 aa4.63□□□□□ -1.67
Gm28254-201ENSMUST00000189207 Vps13bQ80TY5 3993 aa4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 49.7 ms