RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027592.5

Ubxn4-201, Transcript of UBX domain-containing protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubxn4, Length 4,113 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm37013Q8K491 104 aa8.36□□□□□ -1.07
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm9507D3Z5T3 223 aa8.35□□□□□ -1.07
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm16253D3Z167 63 aa8.35□□□□□ -1.07
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm10643Q3URG9 111 aa8.34□□□□□ -1.07
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm12216A0A1W2P827 62 aa8.33□□□□□ -1.08
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Krtap29-1A2A5X4 342 aa8.27□□□□□ -1.08
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cmya5Q70KF4 3739 aa8.27□□□□□ -1.09
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Krtap13O88375 197 aa8.24□□□□□ -1.09
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Krtap10-4Q08EG8 221 aa8.24□□□□□ -1.09
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 2310050C09RikG5E8Z3 280 aa8.21□□□□□ -1.1
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rnase13Q5GAM7 153 aa8.18□□□□□ -1.1
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm4491E0CX42 125 aa8.18□□□□□ -1.1
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Krtap14O08640 167 aa8.16□□□□□ -1.1
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm2310J3QNJ2 377 aa8.15□□□□□ -1.1
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Fbn1Q61554 2873 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 VwfQ8CIZ8 2813 aa8.1□□□□□ -1.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm3646F6S692 53 aa8.09□□□□□ -1.11
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Krtap10-10A0A1W2P7T6 217 aa8.07□□□□□ -1.12
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm3880A0A1B0GSB3 72 aa8.06□□□□□ -1.12
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Col7a1Q63870 2944 aa8.06□□□□□ -1.12
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 1700042G07RikB1AUF7 90 aa8.05□□□□□ -1.12
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4933415A04RikQ9D443 101 aa8.04□□□□□ -1.12
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tnp2P11378 117 aa8.01□□□□□ -1.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tenm2Q9WTS5 2764 aa8□□□□□ -1.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Krtap15-1Q9QZU5 150 aa7.99□□□□□ -1.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Mp68P56379 58 aa7.96□□□□□ -1.14
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Csmd2V9GX34 3611 aa7.95□□□□□ -1.14
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm9821Q8K076 103 aa7.95□□□□□ -1.14
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm9955Q8CEJ8 102 aa7.93□□□□□ -1.14
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm2696A0A1W2P709 240 aa7.9□□□□□ -1.14
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm5767A0A0J9YTU8 78 aa7.85□□□□□ -1.15
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Muc6Q80T03 2850 aa7.8□□□□□ -1.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 CubnQ9JLB4 3623 aa7.79□□□□□ -1.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 CriptO70333 101 aa7.79□□□□□ -1.16
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Megf8P60882 2789 aa7.71□□□□□ -1.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Spink7Q6IE32 76 aa7.7□□□□□ -1.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 D6Ertd527eA0A0N4SWI3 464 aa7.68□□□□□ -1.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rps29P62274 56 aa7.68□□□□□ -1.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cox6b2Q80ZN9 88 aa7.67□□□□□ -1.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rpl37Q9D823 97 aa7.67□□□□□ -1.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 LystP97412 3788 aa7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ank2Q8C8R3 3898 aa7.62□□□□□ -1.19
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm20538F6Z9R1 75 aa7.57□□□□□ -1.2
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm10382Q3V0T5 144 aa7.56□□□□□ -1.2
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Romo1P60603 79 aa7.55□□□□□ -1.2
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Pla2g10Q9QXX3 151 aa7.55□□□□□ -1.2
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Sec61bQ9CQS8 96 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 BC029722A0A0N4SW31 51 aa7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Fam229aB2KGE5 128 aa7.5□□□□□ -1.21
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm5965D3Z724 196 aa7.49□□□□□ -1.21
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 2310079G19RikQ9D6L6 185 aa7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm19426M0QWC7 77 aa7.36□□□□□ -1.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 A930033H14RikG5E8X6 103 aa7.35□□□□□ -1.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Camk2n1Q6QWF9 78 aa7.34□□□□□ -1.23
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm9918Q8BUR5 174 aa7.33□□□□□ -1.24
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm20537G3UYK7 97 aa7.32□□□□□ -1.24
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Xirp2Q4U4S6 3784 aa7.3□□□□□ -1.24
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dnah14A0A140LIJ4 4489 aa7.24□□□□□ -1.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm9736A0A1W2P7N1 277 aa7.21□□□□□ -1.26
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 2310057N15RikQ9D6T8 200 aa7.21□□□□□ -1.26
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Hspg2Q05793 3707 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 BsnO88737 3942 aa7.16□□□□□ -1.26
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ndufaf8A2AMZ4 74 aa7.12□□□□□ -1.27
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm11939A2A592 99 aa7.11□□□□□ -1.27
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Csmd3Q80T79 3707 aa7.11□□□□□ -1.27
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Prm2P07978 107 aa7.08□□□□□ -1.28
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm17416Q30KP4 66 aa7.02□□□□□ -1.29
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Krtap3-2Q9D638 99 aa7□□□□□ -1.29
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Krtap3-3Q9D7P0 99 aa7□□□□□ -1.29
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dnah10D3YYQ8 4591 aa7□□□□□ -1.29
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm21887J3QQ04 176 aa6.95□□□□□ -1.3
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 B930094E09RikQ8C4T2 136 aa6.95□□□□□ -1.3
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Krtap19-5O08632 62 aa6.93□□□□□ -1.3
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 2210017I01RikA0A0A6YVV1 95 aa6.91□□□□□ -1.3
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Huwe1Q7TMY8 4377 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm9112A2AI92 75 aa6.83□□□□□ -1.32
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dnah5Q8VHE6 4621 aa6.81□□□□□ -1.32
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dnah7bL7N1Y0 4068 aa6.8□□□□□ -1.32
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 PlecQ9QXS1 4691 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dnah17Q69Z23 4481 aa6.76□□□□□ -1.33
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm40193A0A1B0GT39 78 aa6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm10318A0A1W2P728 225 aa6.71□□□□□ -1.34
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dnah11E9Q7N9 4488 aa6.68□□□□□ -1.34
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Krtap13-1Q8K198 168 aa6.67□□□□□ -1.34
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Vps13dB1ART2 4390 aa6.67□□□□□ -1.34
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Stard9Q80TF6 4561 aa6.66□□□□□ -1.34
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dnah9B1AR51 4484 aa6.64□□□□□ -1.35
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Krtap3-1A2A591 98 aa6.64□□□□□ -1.35
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tnp1P10856 55 aa6.63□□□□□ -1.35
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Crct1Q6PAI5 102 aa6.6□□□□□ -1.35
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm17402F6Z0L5 76 aa6.59□□□□□ -1.35
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ryr1E9PZQ0 5035 aa6.5□□□□□ -1.37
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Lrp1bQ9JI18 4599 aa6.5□□□□□ -1.37
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 TnxbO35452 4006 aa6.45□□□□□ -1.38
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Kmt2aP55200 3966 aa6.44□□□□□ -1.38
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 PrkdcP97313 4128 aa6.43□□□□□ -1.38
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dync2h1Q45VK7 4306 aa6.4□□□□□ -1.39
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 ApobE9Q414 4505 aa6.38□□□□□ -1.39
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dnah3Q8BW94 4083 aa6.34□□□□□ -1.39
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dnah2P0C6F1 4456 aa6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 51.5 ms