RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000198437.4

Dclk1-208, Transcript of Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Dclk1, Length 4,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Muc4	Q8JZM8	3443 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Nav3	Q80TN7	2359 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Dmxl2	Q8BPN8	3032 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Sorl1	O88307	2215 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	9530053A07Rik	E9PVG8	2581 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Sprr4	Q8CGN8	76 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gcn1	E9PVA8	2671 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Setd2	E9Q5F9	2537 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm21886	J3QJU9	214 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Brwd1	Q921C3	2304 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Smg1	Q8BKX6	3658 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Wfdc13	Q5DQQ6	81 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Trank1	Q8BV79	2999 aa		4.75	□□□□□ -1.65
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Obox2	E9PXV9	151 aa		4.75	□□□□□ -1.65
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Dmac1	Q9CQ00	111 aa		4.75	□□□□□ -1.65
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Psca	P57096	123 aa		4.75	□□□□□ -1.65
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Igkv3-5	A0A140T8M6	119 aa		4.74	□□□□□ -1.65
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Ly6g6c	Q9Z1Q4	126 aa		4.74	□□□□□ -1.65
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Odf3b	Q5M8M2	238 aa		4.74	□□□□□ -1.65
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Defb40	Q70KL2	73 aa		4.74	□□□□□ -1.65
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Tenm4	Q3UHK6	2771 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Notch2	O35516	2470 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Lyst	P97412	3788 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Reg3a	O09037	175 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Mp68	P56379	58 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Reg3b	P35230	175 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Notch3	Q61982	2318 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Atr	Q9JKK8	2635 aa		4.71	□□□□□ -1.65
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Fn1	P11276	2477 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Usp9y	F8VPU6	2556 aa		4.71	□□□□□ -1.66
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	A730009L09Rik	A0A1B0GS82	72 aa		4.7	□□□□□ -1.66
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm3233	E9Q2H5	230 aa		4.69	□□□□□ -1.66
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Helz2	E9QAM5	2947 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
Dclk1-208	ENSMUST00000198437		P84750	121 aa		4.69	□□□□□ -1.66
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Chd9	Q8BYH8	2885 aa		4.69	□□□□□ -1.66
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	1700018G05Rik	A0A1B0GSI2	66 aa		4.67	□□□□□ -1.66
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Nupr2	Q497P3	102 aa		4.66	□□□□□ -1.66
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Romo1	P60603	79 aa		4.65	□□□□□ -1.66
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Camk2n2	Q78WH7	79 aa		4.65	□□□□□ -1.66
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Nsd1	O88491	2588 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	6030445D17Rik	E9Q8F9	148 aa		4.65	□□□□□ -1.67
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Prh1	P05142	261 aa		4.64	□□□□□ -1.67
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Igsf10	Q3V1M1	2594 aa		4.64	□□□□□ -1.67
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm11627	A6PWP4	55 aa		4.64	□□□□□ -1.67
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Rpl37a	P61514	92 aa		4.64	□□□□□ -1.67
Dclk1-208	ENSMUST00000198437		Q8K1L6	76 aa		4.64	□□□□□ -1.67
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Ash1l	Q99MY8	2958 aa		4.64	□□□□□ -1.67
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm28230	A0A0A0MQ91	144 aa		4.63	□□□□□ -1.67
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Itpr2	Q9Z329	2701 aa		4.63	□□□□□ -1.67
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Ptprq	P0C5E4	2300 aa		4.63	□□□□□ -1.67
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm10267	M0QWD8	85 aa		4.63	□□□□□ -1.67
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Wfdc3	Q14AE4	130 aa		4.63	□□□□□ -1.67
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Znf706	Q9D115	76 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm17349	F7BGH6	99 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Polq	Q8CGS6	2544 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Wfdc6b	F6ULY1	148 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Utp20	Q5XG71	2788 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Apln	Q9R0R4	77 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm10139	O88245	57 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm36176	A0A1W2P8D5	158 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Sprr1a	Q62266	144 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Snhg11	Q4G0K9	87 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Adgrg4	B7ZCC9	3073 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Krtap10-10	A0A1W2P7T6	217 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Stab1	Q8R4Y4	2571 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Flnc	Q8VHX6	2726 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm21798	J3QNU5	87 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Igfn1	Q3KNY0	2849 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Nipbl	Q6KCD5	2798 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Fam168b	Q80XQ8	194 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Sycn	Q8VCK7	134 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm7138	L7N2C3	230 aa		4.53	□□□□□ -1.68
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm3238	W4VSP7	230 aa		4.53	□□□□□ -1.68
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Tg	O08710	2766 aa		4.53	□□□□□ -1.68
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Notch1	Q01705	2531 aa		4.53	□□□□□ -1.68
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Defb9	Q8R2I6	67 aa		4.52	□□□□□ -1.69
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Prm2	P07978	107 aa		4.52	□□□□□ -1.69
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm27235	Q3UW50	83 aa		4.51	□□□□□ -1.69
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Svep1	A2AVA0	3567 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Tenm2	Q9WTS5	2764 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Wfdc10	Q3V2J9	124 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Defb38	Q7TNV7	63 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Ank2	Q8C8R3	3898 aa		4.47	□□□□□ -1.69
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Chd6	A3KFM7	2711 aa		4.47	□□□□□ -1.69
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Tenm3	Q9WTS6	2715 aa		4.47	□□□□□ -1.69
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Col6a5	A6H584	2640 aa		4.46	□□□□□ -1.7
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm7137	J3QMW1	236 aa		4.46	□□□□□ -1.7
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Anapc11	Q9CPX9	84 aa		4.46	□□□□□ -1.7
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Hivep1	Q03172	2688 aa		4.45	□□□□□ -1.7
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Celsr2	Q9R0M0	2920 aa		4.45	□□□□□ -1.7
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Krtap14	O08640	167 aa		4.45	□□□□□ -1.7
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Fcgbp	E9Q0B5	2583 aa		4.44	□□□□□ -1.7
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Xirp2	Q4U4S6	3784 aa		4.44	□□□□□ -1.7
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm10065	F6TJM2	114 aa		4.43	□□□□□ -1.7
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Fasn	P19096	2504 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	2310079G19Rik	Q9D6L6	185 aa		4.41	□□□□□ -1.7
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Bsn	O88737	3942 aa		4.41	□□□□□ -1.7
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm16253	D3Z167	63 aa		4.39	□□□□□ -1.71
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gpr15l	A0A0B4J1N3	78 aa		4.39	□□□□□ -1.71
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Dnah1	E9Q8T7	4250 aa		4.38	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 97.4 ms