Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5F9

Setd2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, mousemouse

Predictions only

Length 2,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd2E9Q5F9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Setd2E9Q5F9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Setd2E9Q5F9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Setd2E9Q5F9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Setd2E9Q5F9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Setd2E9Q5F9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Setd2E9Q5F9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Setd2E9Q5F9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Setd2E9Q5F9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Setd2E9Q5F9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Setd2E9Q5F9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Setd2E9Q5F9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setd2E9Q5F9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Setd2E9Q5F9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Setd2E9Q5F9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Setd2E9Q5F9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Setd2E9Q5F9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Setd2E9Q5F9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Setd2E9Q5F9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Setd2E9Q5F9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Setd2E9Q5F9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Setd2E9Q5F9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Setd2E9Q5F9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Setd2E9Q5F9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Setd2E9Q5F9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Setd2E9Q5F9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Setd2E9Q5F9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setd2E9Q5F9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Setd2E9Q5F9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Setd2E9Q5F9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Setd2E9Q5F9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setd2E9Q5F9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setd2E9Q5F9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd2E9Q5F9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setd2E9Q5F9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Setd2E9Q5F9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Setd2E9Q5F9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Setd2E9Q5F9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setd2E9Q5F9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setd2E9Q5F9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Setd2E9Q5F9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setd2E9Q5F9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setd2E9Q5F9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Setd2E9Q5F9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Setd2E9Q5F9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setd2E9Q5F9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setd2E9Q5F9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd2E9Q5F9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Setd2E9Q5F9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Setd2E9Q5F9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Setd2E9Q5F9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setd2E9Q5F9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setd2E9Q5F9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Setd2E9Q5F9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setd2E9Q5F9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setd2E9Q5F9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Setd2E9Q5F9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setd2E9Q5F9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Setd2E9Q5F9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Setd2E9Q5F9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Setd2E9Q5F9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Setd2E9Q5F9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Setd2E9Q5F9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Setd2E9Q5F9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Setd2E9Q5F9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Setd2E9Q5F9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Setd2E9Q5F9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setd2E9Q5F9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Setd2E9Q5F9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Setd2E9Q5F9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Setd2E9Q5F9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Setd2E9Q5F9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Setd2E9Q5F9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Setd2E9Q5F9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Setd2E9Q5F9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Setd2E9Q5F9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Setd2E9Q5F9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Setd2E9Q5F9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Setd2E9Q5F9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Setd2E9Q5F9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Setd2E9Q5F9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Setd2E9Q5F9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Setd2E9Q5F9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Setd2E9Q5F9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setd2E9Q5F9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setd2E9Q5F9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setd2E9Q5F9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setd2E9Q5F9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd2E9Q5F9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setd2E9Q5F9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Setd2E9Q5F9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setd2E9Q5F9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setd2E9Q5F9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Setd2E9Q5F9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setd2E9Q5F9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Setd2E9Q5F9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Setd2E9Q5F9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setd2E9Q5F9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd2E9Q5F9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setd2E9Q5F9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms