RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 SycnQ8VCK7 134 aa11.51□□□□□ -0.57
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm4707V9GXN5 68 aa11.51□□□□□ -0.57
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ube2bP63147 152 aa11.5□□□□□ -0.57
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 TnxbO35452 4006 aa11.49□□□□□ -0.57
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dnah7bL7N1Y0 4068 aa11.49□□□□□ -0.57
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igkv3-4A0A140T8Q4 119 aa11.48□□□□□ -0.57
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 B230307C23RikQ8BLB2 64 aa11.48□□□□□ -0.57
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mrpl34Q99N91 92 aa11.47□□□□□ -0.57
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm17349F7BGH6 99 aa11.45□□□□□ -0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 C130032M10RikQ8C888 123 aa11.45□□□□□ -0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm17521F6QAC8 156 aa11.45□□□□□ -0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm9508A0A1W2P7W0 230 aa11.43□□□□□ -0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm10139O88245 57 aa11.43□□□□□ -0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm10837Q3UTT8 145 aa11.43□□□□□ -0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dync2h1Q45VK7 4306 aa11.42□□□□□ -0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 AI606181Q8C7B9 129 aa11.41□□□□□ -0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 BikO70337 150 aa11.4□□□□□ -0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Chchd10Q7TNL9 138 aa11.4□□□□□ -0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm44790A0A0N4SV91 103 aa11.39□□□□□ -0.59
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wfdc10Q3V2J9 124 aa11.38□□□□□ -0.59
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prr15lQ8JZM2 100 aa11.38□□□□□ -0.59
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 UqcrqQ9CQ69 82 aa11.38□□□□□ -0.59
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Huwe1Q7TMY8 4377 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igkv8-19A0A0G2JFN8 121 aa11.35□□□□□ -0.59
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1700018G05RikA0A1B0GSI2 66 aa11.35□□□□□ -0.59
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Defa28D3Z1V9 94 aa11.34□□□□□ -0.59
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Defa27F2Z403 93 aa11.34□□□□□ -0.59
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Smlr1J3QMJ4 66 aa11.34□□□□□ -0.59
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igkv3-10A0A0G2JGN0 119 aa11.33□□□□□ -0.6
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nupr2Q497P3 102 aa11.33□□□□□ -0.6
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q8K1L6 76 aa11.33□□□□□ -0.6
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Samd13D3YUG0 102 aa11.32□□□□□ -0.6
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Odf3bQ5M8M2 238 aa11.32□□□□□ -0.6
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q8BT88 171 aa11.32□□□□□ -0.6
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 FcgbpE9Q0B5 2583 aa11.32□□□□□ -0.6
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 TgO08710 2766 aa11.32□□□□□ -0.6
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Phf5aP83870 110 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1700012A03RikQ9DAF1 130 aa11.29□□□□□ -0.6
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm10065F6TJM2 114 aa11.29□□□□□ -0.6
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm20604F8WIA3 75 aa11.29□□□□□ -0.6
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Csmd3Q80T79 3707 aa11.28□□□□□ -0.6
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm21886J3QJU9 214 aa11.28□□□□□ -0.6
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ube2aQ9Z255 152 aa11.27□□□□□ -0.6
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm28230A0A0A0MQ91 144 aa11.26□□□□□ -0.61
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wfdc13Q5DQQ6 81 aa11.24□□□□□ -0.61
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Serp1Q9Z1W5 66 aa11.24□□□□□ -0.61
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm27235Q3UW50 83 aa11.23□□□□□ -0.61
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Defb9Q8R2I6 67 aa11.23□□□□□ -0.61
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm10570F6VB42 170 aa11.23□□□□□ -0.61
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pet100P0DJE0 76 aa11.23□□□□□ -0.61
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Spink8Q09TK9 105 aa11.23□□□□□ -0.61
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tenm2Q9WTS5 2764 aa11.22□□□□□ -0.61
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 6030445D17RikE9Q8F9 148 aa11.21□□□□□ -0.62
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Megf8P60882 2789 aa11.21□□□□□ -0.62
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Krtap29-1A2A5X4 342 aa11.19□□□□□ -0.62
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 SnurfQ9WU12 71 aa11.19□□□□□ -0.62
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igkv3-7A0A0G2JE31 119 aa11.17□□□□□ -0.62
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Stab2Q8R4U0 2559 aa11.17□□□□□ -0.62
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Coa6Q8BGD8 79 aa11.17□□□□□ -0.62
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fras1Q80T14 4010 aa11.17□□□□□ -0.62
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igkv3-5A0A140T8M6 119 aa11.16□□□□□ -0.62
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 H2al1aQ5M8Q2 105 aa11.15□□□□□ -0.62
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dnah11E9Q7N9 4488 aa11.14□□□□□ -0.63
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Reg3aO09037 175 aa11.14□□□□□ -0.63
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Brk1Q91VR8 75 aa11.14□□□□□ -0.63
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Defb11Q8R2I7 77 aa11.13□□□□□ -0.63
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 A0A286YE49 62 aa11.12□□□□□ -0.63
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Spint4Q9D263 159 aa11.12□□□□□ -0.63
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Plac8Q9JI48 112 aa11.11□□□□□ -0.63
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm9507D3Z5T3 223 aa11.1□□□□□ -0.63
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Muc6Q80T03 2850 aa11.1□□□□□ -0.63
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rpl37aP61514 92 aa11.09□□□□□ -0.63
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Atox1O08997 68 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dnah9B1AR51 4484 aa11.08□□□□□ -0.64
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm2310J3QNJ2 377 aa11.07□□□□□ -0.64
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PrkdcP97313 4128 aa11.07□□□□□ -0.64
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm10642Q3TWM1 71 aa11.05□□□□□ -0.64
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm9918Q8BUR5 174 aa11.05□□□□□ -0.64
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Znf706Q9D115 76 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PlecQ9QXS1 4691 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NbdyA0A0N4SUI7 68 aa11.05□□□□□ -0.64
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm28374F6SG70 93 aa11□□□□□ -0.65
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cypt14J3QPF7 87 aa10.99□□□□□ -0.65
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cdc42se1Q8BHL7 80 aa10.98□□□□□ -0.65
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gpr15lA0A0B4J1N3 78 aa10.97□□□□□ -0.65
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1700074P13RikQ9D9G7 251 aa10.96□□□□□ -0.65
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pkd1l1Q8R526 2615 aa10.95□□□□□ -0.66
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccdc179J3QM76 67 aa10.95□□□□□ -0.66
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tnp2P11378 117 aa10.95□□□□□ -0.66
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dph3Q8K0W9 82 aa10.95□□□□□ -0.66
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Adm2Q7TNK8 150 aa10.94□□□□□ -0.66
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 A530084C06RikQ3UTW2 186 aa10.94□□□□□ -0.66
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Coa5Q99M07 74 aa10.94□□□□□ -0.66
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ly6g6cQ9Z1Q4 126 aa10.94□□□□□ -0.66
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 2310050C09RikG5E8Z3 280 aa10.93□□□□□ -0.66
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Defb39Q70KL3 74 aa10.93□□□□□ -0.66
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 HrnrQ8VHD8 2496 aa10.9□□□□□ -0.66
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 FasnP19096 2504 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.67
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm16253D3Z167 63 aa10.89□□□□□ -0.67
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igkv3-3A0A140T8Q0 119 aa10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.1 ms