RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm7075D3Z497 112 aa4.67□□□□□ -1.66
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sh2d1aO88890 126 aa4.67□□□□□ -1.66
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cox6b1P56391 86 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Defb29Q8BGW9 78 aa4.67□□□□□ -1.66
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lage3Q9CR70 148 aa4.67□□□□□ -1.66
Clrn3-201ENSMUST00000053716 9430069I07RikQ9CX21 111 aa4.67□□□□□ -1.66
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GfyJ3KML8 504 aa4.66□□□□□ -1.66
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppp1r32Q148A4 427 aa4.66□□□□□ -1.66
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm10549Q3URY4 149 aa4.66□□□□□ -1.66
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ndufa12Q7TMF3 145 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mapk1ip1lQ8BH93 242 aa4.66□□□□□ -1.66
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4930524J08RikQ9CUJ5 163 aa4.66□□□□□ -1.66
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P01755 137 aa4.66□□□□□ -1.66
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Defa2P28309 93 aa4.66□□□□□ -1.66
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Defa25Q5G864 92 aa4.66□□□□□ -1.66
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ighv1-49A0A0A6YWX2 117 aa4.66□□□□□ -1.66
Clrn3-201ENSMUST00000053716 B230359F08RikA0A0B4J1K3 109 aa4.66□□□□□ -1.66
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5089A1L3C8 106 aa4.66□□□□□ -1.66
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm7257D3YX25 99 aa4.66□□□□□ -1.66
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rpl28P41105 137 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cox7a1P56392 80 aa4.66□□□□□ -1.66
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tm2d2Q8R0I4 213 aa4.66□□□□□ -1.66
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bles03Q8VD62 251 aa4.65□□□□□ -1.66
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Akap13E9Q394 2776 aa4.65□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trav13d-4A0A0G2JFX3 110 aa4.65□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm10772F7AIG4 85 aa4.65□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Xcl1P47993 114 aa4.65□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Defb50Q6TU36 73 aa4.65□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hspg2Q05793 3707 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rpl35aO55142 110 aa4.64□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Igf1P05017 153 aa4.64□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 FlnaQ8BTM8 2647 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 D130052B06RikQ3UW13 202 aa4.64□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prss58Q8BW11 241 aa4.64□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 C2cd3Q52KB6 2323 aa4.64□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spata25Q9DA57 226 aa4.64□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfand2aQ9JII7 171 aa4.64□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ank2Q8C8R3 3898 aa4.64□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Il19Q8CJ70 176 aa4.63□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Igkv6-13A0A0G2JGY3 119 aa4.63□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccl21aP84444 133 aa4.63□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccl21bP86792 133 aa4.63□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccl21cP86793 133 aa4.63□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ScxQ64124 207 aa4.63□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tomm7Q9D173 55 aa4.63□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MobpQ9D2P8 170 aa4.63□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dnal4Q9DCM4 105 aa4.63□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tenm3Q9WTS6 2715 aa4.63□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ighv2-9-1A0A075B697 116 aa4.62□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trav13n-2A0A0G2JF93 110 aa4.62□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm16381A0A1Y7VKT9 73 aa4.62□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpha2Q925Q5 128 aa4.62□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MtorQ9JLN9 2549 aa4.62□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ighv8-11A0A075B5X4 119 aa4.62□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trav13-1A0A075B644 110 aa4.62□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Igkv1-99F6XWB2 120 aa4.62□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4930519P11RikQ9CUJ8 166 aa4.62□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hectd1Q69ZR2 2618 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm20726G3UX18 150 aa4.62□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Acyp1P56376 99 aa4.62□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Chchd7Q8K2Q5 85 aa4.62□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hbb-b2P02089 147 aa4.61□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Usp24B1AY13 2617 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Brwd1Q921C3 2304 aa4.61□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Igkv4-72A0A0B4J1I4 117 aa4.61□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm7102J3QQ10 178 aa4.61□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ighv1-56A0A0A6YXG2 117 aa4.6□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Krtap16-1A2A5X5 502 aa4.6□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 7530416G11RikJ3QJX6 159 aa4.6□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NipblQ6KCD5 2798 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp951A0A087WRH0 451 aa4.59□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prh1P05142 261 aa4.59□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Usp9yF8VPU6 2556 aa4.59□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hist1h4aP62806 103 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dand5Q76LW6 185 aa4.59□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5142Q8C5X9 133 aa4.59□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cystm1Q8K353 104 aa4.59□□□□□ -1.67
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ifitm6A0A1B0GS75 124 aa4.59□□□□□ -1.68
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Defb26Q30KN7 186 aa4.59□□□□□ -1.68
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rpl39lQ9CQD0 51 aa4.58□□□□□ -1.68
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Col7a1Q63870 2944 aa4.58□□□□□ -1.68
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lyrm9Q3UN90 78 aa4.58□□□□□ -1.68
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smim26Q3V460 107 aa4.58□□□□□ -1.68
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Csdc2Q91YQ3 154 aa4.58□□□□□ -1.68
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klk11Q9QYN3 276 aa4.58□□□□□ -1.68
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Igkv4-53A0A0G2JFC6 119 aa4.57□□□□□ -1.68
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rpl18aP62717 176 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp462B1AWL2 2495 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Defa4P28311 92 aa4.57□□□□□ -1.68
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Defa7P50705 93 aa4.57□□□□□ -1.68
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4930535I16RikQ9CUI2 172 aa4.57□□□□□ -1.68
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Naa38Q9D2U5 125 aa4.57□□□□□ -1.68
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Epg5Q80TA9 2572 aa4.56□□□□□ -1.68
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Igkv2-109A0A075B5K6 120 aa4.56□□□□□ -1.68
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Odf3l2Q3TZ65 277 aa4.56□□□□□ -1.68
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4930518I15RikQ3V2W7 57 aa4.56□□□□□ -1.68
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trav13-2A0A075B649 110 aa4.56□□□□□ -1.68
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm43218A0A0G2JGT0 114 aa4.56□□□□□ -1.68
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spink4O35679 86 aa4.56□□□□□ -1.68
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ntn5Q3UQ22 452 aa4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.8 ms