RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027351.12

Ccl20-201, Transcript of C-C motif chemokine 20, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccl20, Length 1,417 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Trbv14A0A140T8L9 115 aa5.12□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 DdtO35215 118 aa5.12□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Krtap13O88375 197 aa5.12□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lgals1P16045 135 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pfn1P62962 140 aa5.12□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tex26Q0VB26 296 aa5.12□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Snhg11Q4G0K9 87 aa5.12□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Trav7d-3Q5R1I1 112 aa5.12□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ceacam11Q9D0Z8 303 aa5.12□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Hcfc2Q9D968 241 aa5.12□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Them7Q9DCP4 223 aa5.12□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Trav7-4A0A075B6C1 113 aa5.11□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Nkx6-2D3Z4R4 277 aa5.11□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Foxh1O88621 401 aa5.11□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Prm1P02319 51 aa5.11□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 PigyP0C1P0 71 aa5.11□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Sub1P11031 127 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rps20P60867 119 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 PrcdQ00LT2 53 aa5.11□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rhox4eQ504P9 205 aa5.11□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Trav7d-4Q5R1H9 113 aa5.11□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm10334Q792Y8 246 aa5.11□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Immp2lQ8BPT6 175 aa5.11□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pttg1Q9CQJ7 199 aa5.11□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Morn5Q9DAI9 170 aa5.11□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Trav7n-4A0A075B620 113 aa5.1□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm20517G3UVU6 152 aa5.1□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pglyrp1O88593 182 aa5.1□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ins1P01325 108 aa5.1□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 S100a4P07091 101 aa5.1□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 MdfiP70331 251 aa5.1□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Kcnip4Q6PHZ8 250 aa5.1□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Fam210aQ8BGY7 273 aa5.1□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 4930474N05RikQ8BVR5 218 aa5.1□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Csdc2Q91YQ3 154 aa5.1□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 RetnQ99P87 114 aa5.1□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mrpl20Q9CQL4 149 aa5.1□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Plekhb2Q9QZC7 221 aa5.1□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm15294V9GXA7 121 aa5.1□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Trav14n-3A0A075B645 120 aa5.09□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr1118A0A0J9YUE7 307 aa5.09□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Vmn1r149E9PWL6 307 aa5.09□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Vmn1r101E9Q365 307 aa5.09□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 S100a10P08207 97 aa5.09□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gata1P17679 413 aa5.09□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr1537P34983 314 aa5.09□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 PscaP57096 123 aa5.09□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rpl36aP83882 106 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Trp53rkaQ5U452 244 aa5.09□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Clec4b2Q67DU8 208 aa5.09□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 NpbQ8K4P1 119 aa5.09□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr1367Q8VFG2 316 aa5.09□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mrpl36Q99N90 102 aa5.09□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tp53rkQ99PW4 244 aa5.09□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Fmc1Q9CR13 113 aa5.09□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Q9CR34 168 aa5.09□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Card19Q9D1I2 183 aa5.09□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Smco4Q9JIS3 59 aa5.09□□□□□ -1.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Trav9d-3A0A075B695 113 aa5.08□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Trbv13-2A0A140T8N6 113 aa5.08□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 4930447F04RikA2AFR2 126 aa5.08□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm7735D3YX18 52 aa5.08□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Spink4O35679 86 aa5.08□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tppp2Q0P5Y3 170 aa5.08□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rhox4gQ2MDF7 205 aa5.08□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Khdc1aQ3UWR2 166 aa5.08□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr322Q5NCC8 327 aa5.08□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ss18Q62280 418 aa5.08□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Prss3Q792Z0 246 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tmed6Q9CQG0 239 aa5.08□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lhfpl3Q9CTN8 222 aa5.08□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 BlnkQ9QUN3 457 aa5.08□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Vps13bQ80TY5 3993 aa5.08□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Scgb1b12A0A087WP21 93 aa5.07□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Igkv4-78A0A0A6YYE5 119 aa5.07□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr1320A2AHM8 319 aa5.07□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm10203F6QJ09 66 aa5.07□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm21874J3QNZ6 232 aa5.07□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Smim15Q3UTD9 74 aa5.07□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 ScxQ64124 207 aa5.07□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr1419Q7TQS2 343 aa5.07□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rab4bQ91ZR1 213 aa5.07□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rgs21V9GXQ3 152 aa5.07□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ighv8-8A0A0A6YXQ0 119 aa5.06□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 B230359F08RikA0A0B4J1K3 109 aa5.06□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm6176J3QK59 301 aa5.06□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm10509O88255 85 aa5.06□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Reg3bP35230 175 aa5.06□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pex7P97865 318 aa5.06□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm4567Q3UTA8 301 aa5.06□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ndufa4l2Q4FZG9 87 aa5.06□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr313Q5NC55 308 aa5.06□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr509Q8VF20 321 aa5.06□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gkn1Q9CR36 201 aa5.06□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tppp3Q9CRB6 176 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Borcs7Q9CRC6 105 aa5.06□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gtsf1lQ9CWD0 151 aa5.06□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tmem88Q9D0N8 159 aa5.06□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Trav14d-1A0A075B6B1 121 aa5.06□□□□□ -1.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr1191-ps1A0A1L1STD5 311 aa5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 65.7 ms