Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smim15Q3UTD9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Smim15Q3UTD9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smim15Q3UTD9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smim15Q3UTD9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smim15Q3UTD9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Smim15Q3UTD9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smim15Q3UTD9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smim15Q3UTD9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smim15Q3UTD9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smim15Q3UTD9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smim15Q3UTD9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smim15Q3UTD9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smim15Q3UTD9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smim15Q3UTD9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smim15Q3UTD9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smim15Q3UTD9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smim15Q3UTD9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Smim15Q3UTD9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smim15Q3UTD9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smim15Q3UTD9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smim15Q3UTD9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Smim15Q3UTD9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smim15Q3UTD9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smim15Q3UTD9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smim15Q3UTD9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smim15Q3UTD9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smim15Q3UTD9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smim15Q3UTD9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smim15Q3UTD9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Smim15Q3UTD9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smim15Q3UTD9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim15Q3UTD9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smim15Q3UTD9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smim15Q3UTD9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smim15Q3UTD9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smim15Q3UTD9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smim15Q3UTD9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smim15Q3UTD9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Smim15Q3UTD9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smim15Q3UTD9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smim15Q3UTD9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smim15Q3UTD9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smim15Q3UTD9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smim15Q3UTD9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smim15Q3UTD9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smim15Q3UTD9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Smim15Q3UTD9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smim15Q3UTD9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smim15Q3UTD9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smim15Q3UTD9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smim15Q3UTD9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smim15Q3UTD9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smim15Q3UTD9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smim15Q3UTD9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smim15Q3UTD9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smim15Q3UTD9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smim15Q3UTD9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smim15Q3UTD9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim15Q3UTD9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim15Q3UTD9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim15Q3UTD9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smim15Q3UTD9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Smim15Q3UTD9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Smim15Q3UTD9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smim15Q3UTD9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smim15Q3UTD9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smim15Q3UTD9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smim15Q3UTD9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smim15Q3UTD9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smim15Q3UTD9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Smim15Q3UTD9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smim15Q3UTD9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smim15Q3UTD9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smim15Q3UTD9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smim15Q3UTD9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smim15Q3UTD9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smim15Q3UTD9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smim15Q3UTD9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smim15Q3UTD9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim15Q3UTD9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Smim15Q3UTD9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smim15Q3UTD9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim15Q3UTD9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smim15Q3UTD9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smim15Q3UTD9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim15Q3UTD9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim15Q3UTD9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Smim15Q3UTD9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smim15Q3UTD9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smim15Q3UTD9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smim15Q3UTD9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smim15Q3UTD9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smim15Q3UTD9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smim15Q3UTD9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smim15Q3UTD9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Smim15Q3UTD9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smim15Q3UTD9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smim15Q3UTD9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smim15Q3UTD9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms