Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lhfpl3Q9CTN8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lhfpl3Q9CTN8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lhfpl3Q9CTN8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lhfpl3Q9CTN8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Lhfpl3Q9CTN8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lhfpl3Q9CTN8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lhfpl3Q9CTN8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lhfpl3Q9CTN8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lhfpl3Q9CTN8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lhfpl3Q9CTN8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lhfpl3Q9CTN8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lhfpl3Q9CTN8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lhfpl3Q9CTN8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lhfpl3Q9CTN8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lhfpl3Q9CTN8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lhfpl3Q9CTN8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Lhfpl3Q9CTN8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lhfpl3Q9CTN8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lhfpl3Q9CTN8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lhfpl3Q9CTN8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lhfpl3Q9CTN8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Lhfpl3Q9CTN8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lhfpl3Q9CTN8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lhfpl3Q9CTN8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lhfpl3Q9CTN8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lhfpl3Q9CTN8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lhfpl3Q9CTN8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lhfpl3Q9CTN8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lhfpl3Q9CTN8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lhfpl3Q9CTN8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lhfpl3Q9CTN8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lhfpl3Q9CTN8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lhfpl3Q9CTN8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lhfpl3Q9CTN8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lhfpl3Q9CTN8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lhfpl3Q9CTN8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhfpl3Q9CTN8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lhfpl3Q9CTN8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lhfpl3Q9CTN8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lhfpl3Q9CTN8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lhfpl3Q9CTN8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lhfpl3Q9CTN8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lhfpl3Q9CTN8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lhfpl3Q9CTN8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lhfpl3Q9CTN8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lhfpl3Q9CTN8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lhfpl3Q9CTN8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lhfpl3Q9CTN8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lhfpl3Q9CTN8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lhfpl3Q9CTN8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lhfpl3Q9CTN8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lhfpl3Q9CTN8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lhfpl3Q9CTN8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lhfpl3Q9CTN8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lhfpl3Q9CTN8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lhfpl3Q9CTN8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lhfpl3Q9CTN8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lhfpl3Q9CTN8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lhfpl3Q9CTN8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lhfpl3Q9CTN8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lhfpl3Q9CTN8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lhfpl3Q9CTN8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lhfpl3Q9CTN8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lhfpl3Q9CTN8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lhfpl3Q9CTN8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lhfpl3Q9CTN8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lhfpl3Q9CTN8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lhfpl3Q9CTN8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lhfpl3Q9CTN8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lhfpl3Q9CTN8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lhfpl3Q9CTN8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lhfpl3Q9CTN8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lhfpl3Q9CTN8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lhfpl3Q9CTN8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lhfpl3Q9CTN8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lhfpl3Q9CTN8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lhfpl3Q9CTN8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lhfpl3Q9CTN8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lhfpl3Q9CTN8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lhfpl3Q9CTN8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lhfpl3Q9CTN8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lhfpl3Q9CTN8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lhfpl3Q9CTN8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lhfpl3Q9CTN8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lhfpl3Q9CTN8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lhfpl3Q9CTN8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lhfpl3Q9CTN8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms