Protein–RNA interactions for Protein: O35215

Ddt, D-dopachrome decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DdtO35215 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DdtO35215 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DdtO35215 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DdtO35215 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DdtO35215 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DdtO35215 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DdtO35215 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DdtO35215 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DdtO35215 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DdtO35215 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DdtO35215 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DdtO35215 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DdtO35215 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DdtO35215 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DdtO35215 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DdtO35215 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DdtO35215 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DdtO35215 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DdtO35215 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DdtO35215 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DdtO35215 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DdtO35215 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DdtO35215 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DdtO35215 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DdtO35215 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DdtO35215 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DdtO35215 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DdtO35215 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DdtO35215 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DdtO35215 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DdtO35215 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DdtO35215 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DdtO35215 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DdtO35215 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DdtO35215 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DdtO35215 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DdtO35215 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DdtO35215 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DdtO35215 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DdtO35215 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DdtO35215 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DdtO35215 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DdtO35215 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DdtO35215 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DdtO35215 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DdtO35215 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DdtO35215 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DdtO35215 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DdtO35215 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DdtO35215 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DdtO35215 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DdtO35215 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DdtO35215 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DdtO35215 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DdtO35215 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DdtO35215 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DdtO35215 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DdtO35215 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DdtO35215 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DdtO35215 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DdtO35215 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DdtO35215 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DdtO35215 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DdtO35215 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DdtO35215 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DdtO35215 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DdtO35215 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DdtO35215 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DdtO35215 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DdtO35215 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DdtO35215 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DdtO35215 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DdtO35215 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DdtO35215 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DdtO35215 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DdtO35215 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DdtO35215 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DdtO35215 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DdtO35215 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DdtO35215 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DdtO35215 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DdtO35215 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DdtO35215 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DdtO35215 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DdtO35215 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DdtO35215 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DdtO35215 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DdtO35215 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DdtO35215 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DdtO35215 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DdtO35215 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DdtO35215 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DdtO35215 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DdtO35215 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DdtO35215 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DdtO35215 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DdtO35215 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DdtO35215 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DdtO35215 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DdtO35215 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms