RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019722.11

Ubxn6-201, Transcript of UBX domain-containing protein 6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubxn6, Length 2,949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 PmvkQ9D1G2 192 aa8.35□□□□□ -1.07
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Q9D8Q6 235 aa8.35□□□□□ -1.07
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ins2P01326 110 aa8.35□□□□□ -1.07
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Lmo4P61969 165 aa8.35□□□□□ -1.07
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Klhdc1Q80YG3 406 aa8.35□□□□□ -1.07
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm10295Q8CCF3 114 aa8.35□□□□□ -1.07
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm2564F6Z9S8 108 aa8.34□□□□□ -1.07
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 CckP09240 115 aa8.34□□□□□ -1.07
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Samd10Q7TST3 202 aa8.34□□□□□ -1.07
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 LhbO09108 141 aa8.34□□□□□ -1.07
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Spag11Q8K4N2 71 aa8.34□□□□□ -1.07
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Prr13Q9CQJ5 137 aa8.34□□□□□ -1.07
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tmem262D3Z338 116 aa8.33□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 MsmbO08540 113 aa8.33□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 P01726 129 aa8.33□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 BlcapP62951 87 aa8.33□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cfc1P97766 202 aa8.33□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 C1qcQ02105 246 aa8.33□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Defb33Q30KN3 62 aa8.33□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm17334Q8C6U3 126 aa8.33□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 P01750 117 aa8.33□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 P01820 115 aa8.33□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Rpl13aP19253 203 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ube2d1P61080 147 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cysltr1Q99JA4 352 aa8.33□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Nat8b-psE0CYC6 232 aa8.33□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Q5BN45 167 aa8.33□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gemin7Q9CWY4 129 aa8.33□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm35549A0A0N4SUS7 141 aa8.32□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm45717A0A1B0GT68 152 aa8.32□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Scgb1b24B1B0N6 92 aa8.32□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Mllt11P97783 90 aa8.32□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Mob4Q6PEB6 225 aa8.32□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Q9DAB9 146 aa8.32□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 AcacbE9Q4Z2 2448 aa8.32□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 C920008G01RikA0A0B4J1N1 112 aa8.32□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 P01811 117 aa8.32□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Prr9Q8BV84 116 aa8.32□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Crip2Q9DCT8 208 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cxcl14Q9WUQ5 99 aa8.32□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Hist1h1tQ07133 208 aa8.31□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Defb47Q30KN1 79 aa8.31□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 BC106179Q8C9L1 186 aa8.31□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ovol2Q8CIV7 274 aa8.31□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ifi27l2aQ8R412 90 aa8.31□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 3110018I06RikQ9CXS0 120 aa8.31□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Zfyve26Q5DU37 2529 aa8.31□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ighv5-8A0A075B676 92 aa8.31□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 F11rO88792 300 aa8.31□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Mettl26Q9DCS2 204 aa8.31□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Celsr2Q9R0M0 2920 aa8.31□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tcte2E9PY37 120 aa8.3□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm21748Q3UE70 102 aa8.3□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Il1f10Q8R459 152 aa8.3□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Q9DAQ5 155 aa8.3□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 LystP97412 3788 aa8.3□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ighv1-75A0A075B5Y2 117 aa8.3□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ighv3-3A0A0A6YWL2 116 aa8.3□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ccl24Q9JKC0 119 aa8.3□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Dpm2Q9Z324 84 aa8.3□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Nav3Q80TN7 2359 aa8.3□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Rpl36-ps4A0A140T8U4 117 aa8.3□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm10251J3QPM5 127 aa8.3□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ube2d3P61079 147 aa8.3□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ube2d2P62838 147 aa8.3□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 AY761184Q9D848 116 aa8.3□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Trav6-4A0A075B6B4 115 aa8.29□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Polr2kQ63871 58 aa8.29□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Usp9xP70398 2559 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Utp20Q5XG71 2788 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 FlncQ8VHX6 2726 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ighv12-3A0A075B5T1 117 aa8.29□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ighv8-5A0A0A6YY60 119 aa8.29□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Trbv17A0A140T8P8 114 aa8.29□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm6812B1AXU1 112 aa8.29□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gphb5Q812B2 130 aa8.29□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ankrd39Q9D2X0 183 aa8.29□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ighv1-50A0A075B5W1 117 aa8.28□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Esp24A8R0V6 68 aa8.28□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm10553J3QPF1 123 aa8.28□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 FcorP0DJI6 106 aa8.28□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Lyzl4Q9D925 145 aa8.28□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Lelp1Q9DAE3 120 aa8.28□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Bahcc1Q3UHR0 2643 aa8.28□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Itpr3P70227 2670 aa8.28□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 NbasE9Q411 2356 aa8.28□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ighv1-64A0A075B5X3 117 aa8.28□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm10135F6TEE5 83 aa8.28□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ifitm10Q8BR26 201 aa8.28□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 SNORCQ9CXL7 121 aa8.28□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Iah1Q9DB29 249 aa8.28□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ptpn13Q64512 2453 aa8.28□□□□□ -1.08
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Msrb2Q78J03 175 aa8.27□□□□□ -1.09
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ndufb4Q9CQC7 129 aa8.27□□□□□ -1.09
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Notch3Q61982 2318 aa8.27□□□□□ -1.09
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Igfn1Q3KNY0 2849 aa8.27□□□□□ -1.09
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 OdaphJ3QNT8 126 aa8.27□□□□□ -1.09
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Spink10Q8CAC8 162 aa8.27□□□□□ -1.09
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Abca12E9Q876 2595 aa8.27□□□□□ -1.09
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Srp14P16254 110 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 67.1 ms