RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019722.11

Ubxn6-201, Transcript of UBX domain-containing protein 6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubxn6, Length 2,949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ccdc180J3QNE4 1664 aa18.9■□□□□ 0.62
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Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa17.89■□□□□ 0.45
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Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cngb1E1AZ71 1325 aa17.33■□□□□ 0.36
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Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Sycp2Q9CUU3 1500 aa16.89■□□□□ 0.29
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Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Wdr66E9Q743 1299 aa16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa16.8■□□□□ 0.28
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Synj1Q8CHC4 1574 aa16.8■□□□□ 0.28
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Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa16.51■□□□□ 0.23
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa16.49■□□□□ 0.23
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa16.45■□□□□ 0.22
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 TonslQ6NZL6 1363 aa16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Npm2Q80W85 207 aa16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cep162Q6ZQ06 1403 aa16.42■□□□□ 0.22
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa16.41■□□□□ 0.22
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 CenpbP27790 599 aa16.33■□□□□ 0.21
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Fmn1Q05860 1466 aa16.33■□□□□ 0.2
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Aplp2Q06335 707 aa16.32■□□□□ 0.2
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Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Clip1Q922J3 1391 aa16.32■□□□□ 0.2
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Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa16.18■□□□□ 0.18
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa16.13■□□□□ 0.17
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Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Myt1Q8CFC2 1127 aa16.06■□□□□ 0.16
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Arap1Q4LDD4 1452 aa16.03■□□□□ 0.16
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Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Arhgap35Q91YM2 1499 aa16.02■□□□□ 0.16
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 PtprkP35822 1457 aa16.02■□□□□ 0.15
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Fam71e1A1L3C1 212 aa16.01■□□□□ 0.15
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Eea1Q8BL66 1411 aa15.99■□□□□ 0.15
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Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa15.89■□□□□ 0.13
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 NclP09405 707 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tnnt3Q9QZ47 272 aa15.86■□□□□ 0.13
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Lmod2Q3UHZ5 550 aa15.85■□□□□ 0.13
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 BlmO88700 1416 aa15.85■□□□□ 0.13
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ccdc18Q640L5 1455 aa15.85■□□□□ 0.13
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 NrkQ9R0G8 1455 aa15.85■□□□□ 0.13
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Baz1bQ9Z277 1479 aa15.84■□□□□ 0.13
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Ubxn6-201ENSMUST00000019722 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
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