Protein–RNA interactions for Protein: P01726

Ig lambda-1 chain V region H2020, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01726 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
P01726 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
P01726 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
P01726 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
P01726 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
P01726 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
P01726 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
P01726 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
P01726 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
P01726 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
P01726 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
P01726 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
P01726 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
P01726 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
P01726 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
P01726 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
P01726 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
P01726 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
P01726 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
P01726 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
P01726 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
P01726 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
P01726 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
P01726 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
P01726 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
P01726 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
P01726 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
P01726 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P01726 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
P01726 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
P01726 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P01726 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P01726 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
P01726 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
P01726 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
P01726 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
P01726 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
P01726 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
P01726 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P01726 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
P01726 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
P01726 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
P01726 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
P01726 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
P01726 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
P01726 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
P01726 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P01726 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
P01726 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P01726 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P01726 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
P01726 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P01726 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01726 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
P01726 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01726 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01726 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01726 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
P01726 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01726 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01726 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01726 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01726 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01726 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01726 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01726 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01726 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01726 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
P01726 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01726 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01726 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01726 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01726 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01726 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
P01726 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P01726 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01726 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01726 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01726 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01726 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01726 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01726 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01726 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01726 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01726 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
P01726 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01726 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01726 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
P01726 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01726 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01726 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01726 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01726 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01726 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01726 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01726 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01726 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
P01726 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01726 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01726 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms