RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000041638.7

Gtf3c3-201, Transcript of General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c3, Length 4,582 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gm5741B2RVA4 72 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 1500009C09RikD3YYW9 81 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gm9767G3X930 207 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Phxr5P08399 672 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Defa1P11477 93 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Duxbl2Q7TNE6 350 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Nkg7Q99PA5 165 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Hyls1Q9CXX0 307 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Tmprss5Q9ER04 455 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Herc2Q4U2R1 4836 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Ighv14-1A0A075B5R4 117 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Tcrg-C1A0A075B5Z0 172 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Trav6n-5A0A075B621 112 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Trav4-2A0A075B638 110 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Trav6-5A0A075B6B5 112 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Ighv9-4A0A0A6YWH6 117 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Ighv6-4A0A0A6YX19 119 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gm20825J3QM67 227 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 TcraP01849 138 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Tmem213Q08EA8 116 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Ssty2Q149W4 227 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gm21394Q497R7 227 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gm20854Q62461 227 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 A830031A19RikQ8BNT5 113 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gpr132Q9Z282 382 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 PdfS4R2K0 231 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Tcrg-C3L7N479 172 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 P03985 172 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Znf239P24399 201 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Ccl6P27784 116 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Psg27Q497W2 474 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Cd33Q63994 403 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Rpp25lQ99JH1 163 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Shisal2bQ9D1Y9 158 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Rnf114Q9ET26 229 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Fat3Q8BNA6 4555 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Ighv6-3A0A075B5T2 118 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gm7075D3Z497 112 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Glrx2Q923X4 156 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 RetnQ99P87 114 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4930544G11RikQ9CR99 193 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Mrpl52Q9D0Y8 121 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Tspan13Q9D8C2 204 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Ighv1-4A0A075B5T4 117 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Igkv1-133A0A0B4J1H8 120 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Igkv4-71A0A0G2JEH0 117 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 PkigO70139 76 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Smrp1Q2MH31 260 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 A630076J17RikJ3QQ32 107 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gm6871L7N248 545 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 P01741 114 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gm94Q3V2D2 93 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Q5BN45 167 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Znf474Q6V5K9 347 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Pla2g2eQ9QUL3 142 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 FasnP19096 2504 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Trav21-dv12A0A075B6C4 109 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Tm4sf19E9Q9H8 206 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gm8439G3UWA7 96 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Rnase1P00683 149 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Rpl23P62830 140 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gm10447Q3UQ92 135 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Ang2Q64438 145 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Jpt2Q6PGH2 190 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Dusp14Q9JLY7 198 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Dnhd1D3Z2X2 4750 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gm28845A0A087WR76 214 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Ighv8-2A0A0A6YW58 119 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Cox11Q6P8I6 275 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Tmem91Q8C581 172 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Vmn1r216Q8R257 298 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Sh3bgrl3Q91VW3 93 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Atp5lQ9CPQ8 103 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Esm1Q9QYY7 184 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gm10203F6QJ09 66 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Efnb3O35393 340 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Ly6g5bQ8K1T4 194 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 UrahQ9CRB3 118 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Cbln1Q9R171 193 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Kiaa1109A2AAE1 5005 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Trav9d-1A0A075B699 112 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Olfr1016A2ASV2 309 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Vmn1r1E9PVR6 306 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Ccl17F6R5P4 103 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Cmc4Q61908 68 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 OstcQ78XF5 149 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Pygo2Q80V76 405 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Olfr498Q8VEW2 330 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Cldn16Q925N4 235 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Necap2Q9D1J1 266 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Trbv30A0A0B4J1P1 111 aa3.25□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Bsph1Q3UW26 133 aa3.25□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Olfr317Q5NCD6 327 aa3.25□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gphb5Q812B2 130 aa3.25□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Ube2e2Q91W82 201 aa3.25□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Obox1Q9D350 204 aa3.25□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Mrps11Q9DCA2 191 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 PerpQ9JK95 193 aa3.25□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 SelenokQ9JLJ1 94 aa3.25□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gm28269A0A087WSG3 125 aa3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 64.9 ms