RNA–Protein interactions for RNA: YJL050W

MTR4, Transcript of ATP-dependent 3'-5' RNA helicase of the DExD/H family, yeast

Gene MTR4, Length 3,222 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTR4	YJL050W	YDL109C	Q12103	647 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YOR214C	Q12282	236 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	SNF3	P10870	884 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	HSF1	P10961	833 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	RAP1	P11938	827 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	MRPL25	P23369	157 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	HXT2	P23585	541 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YSP3	P25036	478 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	NPP1	P25353	742 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	DGR2	P32330	852 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	NIC96	P34077	839 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	SKG1	P36169	355 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	BAP2	P38084	609 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YBL036C	P38197	257 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	FMP23	P38231	175 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YBR259W	P38338	688 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	SDH8	P38345	138 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	TRM5	P38793	499 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	PSY2	P40164	858 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	LCB2	P40970	561 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	ASE1	P50275	885 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	DIA3	P52290	468 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YGR016W	P53209	190 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YOL019W	Q08157	551 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YOL107W	Q12239	342 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	RRI2	Q12348	645 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	IMA3	P0CW40	589 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	IMA4	P0CW41	589 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	SNF4	P12904	322 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	SEN2	P16658	377 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	CTR86	P25355	563 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	CDC20	P26309	610 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	PHO91	P27514	894 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	SAS3	P34218	831 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	ECM13	P38195	257 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YJR061W	P40355	935 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	MAD3	P47074	515 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	RSM26	P47141	266 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	MRK1	P50873	501 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YCS4	Q06156	1176 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	IMA2	Q08295	589 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	SGT1	Q08446	395 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	ESA1	Q08649	445 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	MED1	Q12321	566 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	HAT1	Q12341	374 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	SPO16	P17122	198 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	MEF1	P25039	761 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YCL049C	P25577	312 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	SPT14	P32363	452 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	TAF14	P35189	244 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	VRP1	P37370	817 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	PAC11	P40960	533 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	PHB1	P40961	287 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	HOC1	P47124	396 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	RMR1	P53060	241 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YGR273C	P53329	174 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	IPI3	P53877	555 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	PNG1	Q02890	363 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	JIP4	Q03361	876 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YPS7	Q06325	596 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	MAM3	Q12296	706 aa		3.55	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	AEP1	P32493	518 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	MDJ1	P35191	511 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	NAT2	P37293	288 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	POP4	P38336	279 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YDR089W	P38966	869 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	DSS1	P39112	969 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	ECM10	P39987	644 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	ARG2	P40360	574 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	BST1	P43571	1029 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YDR476C	Q03362	224 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	BCP1	Q06338	283 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	REH1	Q06709	432 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YEH2	Q07950	538 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YLR053C	Q12026	108 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YPR1	Q12458	312 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	DAP2	P18962	818 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	COQ8	P27697	501 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	SPR1	P32603	445 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84

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