RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRD1	YCL057W	UBS1	P38290	277 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PRD1	YCL057W	YHL017W	P38745	532 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PRD1	YCL057W	ACA1	P39970	489 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PRD1	YCL057W	TMN3	P40071	706 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PRD1	YCL057W	YGR021W	P53212	290 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PRD1	YCL057W	HST1	P53685	503 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PRD1	YCL057W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PRD1	YCL057W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.57
PRD1	YCL057W	SET3	P36124	751 aa		5.21	□□□□□ -1.57
PRD1	YCL057W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.57
PRD1	YCL057W	LRO1	P40345	661 aa		5.21	□□□□□ -1.57
PRD1	YCL057W	DSD1	P53095	428 aa		5.21	□□□□□ -1.57
PRD1	YCL057W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.57
PRD1	YCL057W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.57
PRD1	YCL057W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	BIK1	P11709	440 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	YKL222C	P35995	705 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	RSM25	P40496	264 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	MAD3	P47074	515 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	ATG4	P53867	494 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	SSL2	Q00578	843 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	USV1	Q12132	391 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	HOS1	Q12214	470 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	FUB1	P25659	250 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	SLI1	P53304	468 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	MUK1	Q02866	612 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	GSM1	P42950	618 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	YDL086W	Q07505	273 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	VPS33	P20795	691 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	LTV1	P34078	463 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	MRPL10	P36520	322 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	MDR1	P53258	950 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	YGR151C	P53287	111 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	SNF12	P53628	566 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	CIA1	Q05583	330 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	ACF2	Q12168	779 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	ABF1	P14164	731 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	PCL5	P38794	229 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	YEL025C	P39991	1188 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	SFI1	Q12369	946 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	LYS2	P07702	1392 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	MSH1	P25846	959 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	DBF20	P32328	564 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	PTH2	P34222	208 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	MRPL7	P36519	292 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	APM3	P38153	483 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	SPC72	P39723	622 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	SMC3	P47037	1230 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	YMR206W	Q03695	313 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	AAD4	Q07747	329 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	PHO81	P17442	1178 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	TCD1	P38756	429 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	YJL193W	P39542	402 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	NDC80	P40460	691 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	STU2	P46675	888 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	YNL050C	P53952	270 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	CRD1	Q07560	283 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	MCH5	Q08777	521 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	CDC16	P09798	840 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	MSM1	P22438	575 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	ARG2	P40360	574 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	STB4	P50104	949 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	APC1	P53886	1748 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	RAD24	P32641	659 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	ELF1	P36053	145 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	CIN4	P39110	191 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	CTF4	Q01454	927 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	ACS1	Q01574	713 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	PSR2	Q07949	397 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	RKI1	Q12189	258 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	SIR1	P21691	654 aa		5.15	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	MBR1	P23493	339 aa		5.15	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	PPE1	P38796	400 aa		5.15	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	POL31	P46957	487 aa		5.15	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	ENT2	Q05785	613 aa		5.15	□□□□□ -1.58
PRD1	YCL057W	PCK1	P10963	549 aa		5.15	□□□□□ -1.59

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